应该怎样寻找基因启动子区呢?
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
应该怎样寻找基因启动子区呢?
小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
這個(gè)主要是通過計(jì)算機(jī)方法,有幾種選擇。作為一個(gè)規(guī)則,通過多種方法預(yù)測的外顯子提高了預(yù)測的正確率而不會(huì)出現(xiàn)“假陽性”結(jié)果。多數(shù)方法顯示3′端非翻譯區(qū),以左側(cè)大而短的塊狀表示。Acembly路徑顯示除了全長序列產(chǎn)物(如這個(gè)部分第3條線所示)之外還有3個(gè)可能的選擇性剪接,其它大多數(shù)路徑顯示與此預(yù)測結(jié)果相符。Genscan路徑從左、右方向往遠(yuǎn)處延伸:GENSCAN可以被用于預(yù)測多個(gè)基因。推薦一篇文章:http://wenku.baidu.com/view/78 ... .html
啟動(dòng)子是基因(gene)的一個(gè)組成部分,控制基因表達(dá)(轉(zhuǎn)錄)的起始時(shí)間和表達(dá)的程度。 基因啟動(dòng)子位于基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的上游幾kb的區(qū)域內(nèi),一般來說啟動(dòng)子區(qū)域具有一定的保守序列特征,另外,啟動(dòng)子區(qū)域一般還具有比較高比例的GC含量,這些高GC含量的區(qū)域組成一些GC島;如果一個(gè)新的基因在不能確定其啟動(dòng)子的情況下,最好在設(shè)計(jì)PCR引物時(shí),多設(shè)計(jì)幾對(duì),最大限度地將新基因的啟動(dòng)子區(qū)域囊括在這些PCR里面。
啟動(dòng)子是參與特定基因轉(zhuǎn)錄及其調(diào)控的DNA序列。包含核心啟動(dòng)子區(qū)域和調(diào)控區(qū)域。核心啟動(dòng)子區(qū)域產(chǎn)生基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄,調(diào)控區(qū)域能夠?qū)Σ煌沫h(huán)境條件作出應(yīng)答,對(duì)基因的表達(dá)水平做出相應(yīng)的調(diào)節(jié)。對(duì)于如何查找啟動(dòng)子,現(xiàn)在又很多軟件可以應(yīng)用,而且ncbi上也可以應(yīng)用,所以是比較方便的。
一般來說從數(shù)據(jù)庫找。像是NCBI之類的,網(wǎng)上有教程的,像是http://wenku.baidu.com/link%3F ... KZYEe
啟動(dòng)子是基因(gene)的一個(gè)組成部分,控制基因表達(dá)(轉(zhuǎn)錄)的起始時(shí)間和表達(dá)的程度。 基因啟動(dòng)子位于基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的上游幾kb的區(qū)域內(nèi),一般來說啟動(dòng)子區(qū)域具有一定的保守序列特征,另外,啟動(dòng)子區(qū)域一般還具有比較高比例的GC含量,這些高GC含量的區(qū)域組成一些GC島;如果一個(gè)新的基因在不能確定其啟動(dòng)子的情況下,最好在設(shè)計(jì)PCR引物時(shí),多設(shè)計(jì)幾對(duì),最大限度地將新基因的啟動(dòng)子區(qū)域囊括在這些PCR里面。
啟動(dòng)子是參與特定基因轉(zhuǎn)錄及其調(diào)控的DNA序列。包含核心啟動(dòng)子區(qū)域和調(diào)控區(qū)域。核心啟動(dòng)子區(qū)域產(chǎn)生基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄,調(diào)控區(qū)域能夠?qū)Σ煌沫h(huán)境條件作出應(yīng)答,對(duì)基因的表達(dá)水平做出相應(yīng)的調(diào)節(jié)。對(duì)于如何查找啟動(dòng)子,現(xiàn)在又很多軟件可以應(yīng)用,而且ncbi上也可以應(yīng)用,所以是比較方便的。
一般來說從數(shù)據(jù)庫找。像是NCBI之類的,網(wǎng)上有教程的,像是http://wenku.baidu.com/link%3F ... KZYEe
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的应该怎样寻找基因启动子区呢?的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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