关于人类基因开源社区的构想靠谱么?
生活随笔
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关于人类基因开源社区的构想靠谱么?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
門檻問題,設備等等,我個人覺得是限制條件之一,其次是人才問題,一般網友顯然不具備相關的知識儲備或者實戰的經驗,所以構想可能實現,不過不是目前,而且很多的數據庫不都是公共的嗎?我作為一個基因愛好者,經常NCBI和EMBL上耍一耍。
理念正確,但實現路徑可能比預期要繁瑣很多。整體來講,我是支持開源和共享的。
我覺得這個東西不是太像內行寫的對于第一步,所謂“基因的定位 外顯子數目 外顯子序列”都是基因組序列reference及其功能注釋的內容,公共數據庫已有。對于“SNP Indel”,說的是自己測序得到的數據呢還是人類共有的呢?就其字面理解,應該是后者,這個也已經有成熟的公開數據庫dbSNP了第二步,實際上是做一個針對于中國人的dbSNP庫的子庫,大致不困難吧。“根據SNP解析出該突變會引起的病變或者個體差異”是一個美好的愿景,至今人們能解釋的SNP和表型(疾病、性狀)的關系(因果關系或者是概率)也不過區區幾千個。想擴充這方面的認知,龐大的數據量、嚴謹的樣本信息、有效的統計工具、靠譜的遺傳學實驗設計都是少不了的第三步,試劑研發是難點??不就是設計個PCR引物然后測一下sanger么(或者甚至不需要測序,直接設計引物看有沒有條帶,前提是假陰性控制得好)。亦或者是整合幾萬個位點做個芯片,就像23&me或360一樣。總之,這一步并非難點
有一定的前景,不過豐富起來比較累。另一個,這個算是更大的一個NCBI么?
理念正確,但實現路徑可能比預期要繁瑣很多。整體來講,我是支持開源和共享的。
我覺得這個東西不是太像內行寫的對于第一步,所謂“基因的定位 外顯子數目 外顯子序列”都是基因組序列reference及其功能注釋的內容,公共數據庫已有。對于“SNP Indel”,說的是自己測序得到的數據呢還是人類共有的呢?就其字面理解,應該是后者,這個也已經有成熟的公開數據庫dbSNP了第二步,實際上是做一個針對于中國人的dbSNP庫的子庫,大致不困難吧。“根據SNP解析出該突變會引起的病變或者個體差異”是一個美好的愿景,至今人們能解釋的SNP和表型(疾病、性狀)的關系(因果關系或者是概率)也不過區區幾千個。想擴充這方面的認知,龐大的數據量、嚴謹的樣本信息、有效的統計工具、靠譜的遺傳學實驗設計都是少不了的第三步,試劑研發是難點??不就是設計個PCR引物然后測一下sanger么(或者甚至不需要測序,直接設計引物看有沒有條帶,前提是假陰性控制得好)。亦或者是整合幾萬個位點做個芯片,就像23&me或360一樣。總之,這一步并非難點
有一定的前景,不過豐富起來比較累。另一個,這個算是更大的一個NCBI么?
總結
以上是生活随笔為你收集整理的关于人类基因开源社区的构想靠谱么?的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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