SNP检测技术有哪些?
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
SNP检测技术有哪些?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
樓主列舉的已經很全面了,稍微補充一下:Transgenomic公司的WAVE?核苷酸片段分析系統是高通量且較為準確可靠的篩查未知、已知SNP的新方法。利用 Transgenomic公司的WAVE?核苷酸片段分析系統進行SNP檢測平均每個樣本的費用為$0.5。
質譜分析法(mass spectrometry)該方法利用質譜分析對質量的靈敏度特別高的特點,很容易將僅含有一個不同堿基的兩段基因序列區別開的特點,使用質譜直接或間接檢測等位基因特異性延伸區的反應產物,推導出SNP。單堿基延伸或其修飾形式與基質輔助激光吸收/離子飛行時間(MALDI-TOF)質譜結合已被廣泛的應用,并已被美國公司(Sequenom)發展為商業性產品。我公司提供的SNP檢測技術服務,就是基于這樣的方法。DNA芯片技術(DNA chip) 將已知序列的寡核苷酸DNA排列在1塊集成電路板上,將熒光標記的正常DNA和突變DNA發別與2塊DNA芯片雜交,由于至少存在1個堿基的差異,正常和突變的DNA將會得到不同的雜交圖譜,經過共聚集顯微鏡檢測兩種DNA分子產生的熒光信號,確定是否存在突變。限制性片段長度多態性分析法(RFLP)RFLP技術利用限制性核酸內切酶識別并剪切特定DNA序列的能力,檢測基因片段上限制性核酸內切酶識別位點處是否存在核苷酸突變。應用限制性內切酶對兩個等位基因識別的差異,產生不同大小的切割片段,通過電泳遷移率的不同來判定是否存在SNP。實時熒光PCR分析法使用針對核酸中不同多態性序列的熒光Taqman探針,它們在PCR擴增中被水解釋放熒光信號,只有與靶序列完全匹配的探針才能被相應的切割。不同探針標記不同的熒光報道信號。利用多通道熒光PCR儀檢測結果,可以便捷判斷核酸多態性。單鏈構象多態性分析法(SSCP)在非變性聚丙烯酰胺凝膠上,短的單鏈DNA和RNA分子依其大堿基序列不同而形成不同構象,一個堿基的改變將影響其構象而導致其在凝膠上的移動速度改變。DNA測序法(DNA sequencing)雙脫氧終止法,引物用四種不同前顏色的熒光標記,使每個樣品的四個測序反應可在一個反應管和一個泳道內進行。
質譜分析法(mass spectrometry)該方法利用質譜分析對質量的靈敏度特別高的特點,很容易將僅含有一個不同堿基的兩段基因序列區別開的特點,使用質譜直接或間接檢測等位基因特異性延伸區的反應產物,推導出SNP。單堿基延伸或其修飾形式與基質輔助激光吸收/離子飛行時間(MALDI-TOF)質譜結合已被廣泛的應用,并已被美國公司(Sequenom)發展為商業性產品。我公司提供的SNP檢測技術服務,就是基于這樣的方法。DNA芯片技術(DNA chip) 將已知序列的寡核苷酸DNA排列在1塊集成電路板上,將熒光標記的正常DNA和突變DNA發別與2塊DNA芯片雜交,由于至少存在1個堿基的差異,正常和突變的DNA將會得到不同的雜交圖譜,經過共聚集顯微鏡檢測兩種DNA分子產生的熒光信號,確定是否存在突變。限制性片段長度多態性分析法(RFLP)RFLP技術利用限制性核酸內切酶識別并剪切特定DNA序列的能力,檢測基因片段上限制性核酸內切酶識別位點處是否存在核苷酸突變。應用限制性內切酶對兩個等位基因識別的差異,產生不同大小的切割片段,通過電泳遷移率的不同來判定是否存在SNP。實時熒光PCR分析法使用針對核酸中不同多態性序列的熒光Taqman探針,它們在PCR擴增中被水解釋放熒光信號,只有與靶序列完全匹配的探針才能被相應的切割。不同探針標記不同的熒光報道信號。利用多通道熒光PCR儀檢測結果,可以便捷判斷核酸多態性。單鏈構象多態性分析法(SSCP)在非變性聚丙烯酰胺凝膠上,短的單鏈DNA和RNA分子依其大堿基序列不同而形成不同構象,一個堿基的改變將影響其構象而導致其在凝膠上的移動速度改變。DNA測序法(DNA sequencing)雙脫氧終止法,引物用四種不同前顏色的熒光標記,使每個樣品的四個測序反應可在一個反應管和一個泳道內進行。
總結
以上是生活随笔為你收集整理的SNP检测技术有哪些?的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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