RNAcentral指的是什么?有哪些特点和应用?
生活随笔
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RNAcentral指的是什么?有哪些特点和应用?
小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
這是第一個(gè)統(tǒng)一所有類型的非編碼RNA數(shù)據(jù)的資源!!!已由RNAcentral聯(lián)盟啟動(dòng)。它聚集了來自一個(gè)專家數(shù)據(jù)庫聯(lián)合會(huì)的信息,并提供方便的瀏覽工具。RNAcentral的首次發(fā)行包含大約800萬個(gè)序列。這一資源利用EMBL-EBI的基礎(chǔ)設(shè)施,尤其是歐洲核苷酸檔案(ENA)提供的數(shù)據(jù)提交和交叉參考服務(wù)。它利用來自國際核苷酸序列數(shù)據(jù)庫合作(INSDC)的全球同步數(shù)據(jù)。RNAcentral的未來版本將包括關(guān)于RNA結(jié)構(gòu)、修飾、分子間相互作用和功能的附加數(shù)據(jù)類型和信息。
補(bǔ)充:在RNAcentral之前,尋找由特定基因組編碼的RNA,需要從幾個(gè)獨(dú)立的資源提取信息,例如從miRBase提取microRNA,從HAVANA提取lncRNA信息。RNAcentral 1.0提供十種不同專家數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)訪問,并提供穩(wěn)定的登錄號(hào),可以始終用于文獻(xiàn)、其他分子數(shù)據(jù)庫和搜索引擎中。RNAcentral網(wǎng)站的特點(diǎn)是分面檢索,這可讓用戶根據(jù)來源、物種和分子功能,搜索不同的RNA序列。RNAcentral聯(lián)盟起源于Wellcome Genome Campus在2010年舉辦的一次研討會(huì),當(dāng)時(shí)RNA團(tuán)體的成員聚集在一起,討論集中訪問RNA數(shù)據(jù)方面的不足。RNAcentral是一種至關(guān)重要的資源,將把信息整合和集成為統(tǒng)一數(shù)據(jù),并提高世界各地研究人員對(duì)數(shù)據(jù)的發(fā)現(xiàn)和利用。
補(bǔ)充:在RNAcentral之前,尋找由特定基因組編碼的RNA,需要從幾個(gè)獨(dú)立的資源提取信息,例如從miRBase提取microRNA,從HAVANA提取lncRNA信息。RNAcentral 1.0提供十種不同專家數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)訪問,并提供穩(wěn)定的登錄號(hào),可以始終用于文獻(xiàn)、其他分子數(shù)據(jù)庫和搜索引擎中。RNAcentral網(wǎng)站的特點(diǎn)是分面檢索,這可讓用戶根據(jù)來源、物種和分子功能,搜索不同的RNA序列。RNAcentral聯(lián)盟起源于Wellcome Genome Campus在2010年舉辦的一次研討會(huì),當(dāng)時(shí)RNA團(tuán)體的成員聚集在一起,討論集中訪問RNA數(shù)據(jù)方面的不足。RNAcentral是一種至關(guān)重要的資源,將把信息整合和集成為統(tǒng)一數(shù)據(jù),并提高世界各地研究人員對(duì)數(shù)據(jù)的發(fā)現(xiàn)和利用。
總結(jié)
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