RNA-Seq技术的准确性,重复性如何?
生活随笔
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RNA-Seq技术的准确性,重复性如何?
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
RNA-Seq可進(jìn)行全基因組水平的基因表達(dá)差異研究,具有定量更準(zhǔn)確、可重復(fù)性更高、檢測(cè)范圍更廣、分析更可靠等特點(diǎn)。除了分析基因表達(dá)水平,RNA-Seq還能發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本、SNP、剪接變體,并提供等位基因特異的基因表達(dá)。 RNA-Seq的動(dòng)態(tài)范圍更廣,且假陽(yáng)性可能更小,這意味著RNA-Seq的數(shù)據(jù)重復(fù)性應(yīng)當(dāng)比芯片要高。RNA-Seq能夠檢測(cè)樣品中的所有RNA,這對(duì)于鑒定細(xì)胞的新穎轉(zhuǎn)錄本來(lái)說(shuō)是個(gè)優(yōu)點(diǎn),但同時(shí)缺點(diǎn)在于,它檢測(cè)了總的RNA,而細(xì)胞中很大一部分RNA都來(lái)自核糖體和線粒體。這限制了其他RNA的讀取數(shù)量以及這些RNA表達(dá)水平的準(zhǔn)確性。因此,polyA RNA選擇和核糖體RNA去除等方法被開(kāi)發(fā)出來(lái),以便解決這個(gè)問(wèn)題。然而,這些分離方法有可能會(huì)引入潛在誤差,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
總結(jié)
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