RNA-Seq技术的准确性,重复性如何?
生活随笔
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RNA-Seq技术的准确性,重复性如何?
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RNA-Seq可進行全基因組水平的基因表達差異研究,具有定量更準確、可重復性更高、檢測范圍更廣、分析更可靠等特點。除了分析基因表達水平,RNA-Seq還能發現新的轉錄本、SNP、剪接變體,并提供等位基因特異的基因表達。 RNA-Seq的動態范圍更廣,且假陽性可能更小,這意味著RNA-Seq的數據重復性應當比芯片要高。RNA-Seq能夠檢測樣品中的所有RNA,這對于鑒定細胞的新穎轉錄本來說是個優點,但同時缺點在于,它檢測了總的RNA,而細胞中很大一部分RNA都來自核糖體和線粒體。這限制了其他RNA的讀取數量以及這些RNA表達水平的準確性。因此,polyA RNA選擇和核糖體RNA去除等方法被開發出來,以便解決這個問題。然而,這些分離方法有可能會引入潛在誤差,影響實驗結果。
總結
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