CRISPR ，成簇的規律間隔的短回文重復序列，通過調節適應性細菌免疫系統的這一功能呢，區分病毒是敵是友。病毒在它們的溶菌階段利用細胞的機器來復制自身，然后破壞細胞釋放出新病毒。與此同時，病毒在它們的溶原階段悄悄地整合到宿主遺傳物質之中。這就是它們向細菌提供潛在利益之處，細菌可以挑選出一些病毒基因來實現自身的目的。這個過程就是適應性細菌免疫系統，由CRISPR/Cas系統調節。

細菌CRISPR/Cas適應性免疫系統調節機理：該系統的功能依賴于CRISPRs。CRISPR 指的是成簇的規律間隔的短回文重復序列，長度約25～50bp的重復序列（repeats），被間隔序列(spacer)所間隔。這些間隔序列與病毒遺傳密碼中的序列相匹配，CRISPR相關基因(CRISPR-associated genes，Cas)編碼的酶將CRISPR DNA轉錄的RNA中的間隔序列切除出來。隨后其他Cas酶利用這些間隔序列作為引導靶向破壞入侵病毒的基因。但是有些病毒也進化出了一套逃過該系統的機制：有時候病毒能夠通過靶序列突變來阻止CRISPR-Cas系統識別它們。

總結

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