比较LIFE、ILLUMINA、华大基因的测序仪优劣?
生活随笔
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比较LIFE、ILLUMINA、华大基因的测序仪优劣?
小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
CG的優(yōu)勢:SNP檢測準確度高,通量大,cPAL技術(shù)利于基因分型。。。
目前,illumina確實是主流。Life的技術(shù)原理很苦炫,可惜準確度是個很大的問題。CG的適合“shiquan”所說的特定應用
通過一些公開的信息,簡單做一個比較:1、Life:最初的SOLid已退市,讀長較短,70-75,買了PGM,升級版IONProton,主推的產(chǎn)品速度快,用半導體檢測離子電流,綜合成本低于光學檢測,操作簡便。缺點在于穩(wěn)定性和準確性,依賴于實驗條件和水質(zhì)環(huán)境。2、Illumina:份額最大,優(yōu)勢在于市場上通量最高,準確性可以接受,好于life,缺陷在于讀長100-150,在全球形成壟斷狀態(tài),據(jù)說對全球的消耗市場,每年漲價4%,應用成本高。3、華大基因收購CompleteGenomics(簡稱CG):最早不賣測序儀,只是生產(chǎn)設(shè)備,進行測序服務,華大收購后,CG最大優(yōu)勢在于設(shè)備和試劑自產(chǎn),成本可控,通量可根據(jù)生產(chǎn)線擴大而擴大,但技術(shù)上劣勢在于讀長更短,只有10幾到20幾。對數(shù)據(jù)分析影響很大。
目前,illumina確實是主流。Life的技術(shù)原理很苦炫,可惜準確度是個很大的問題。CG的適合“shiquan”所說的特定應用
通過一些公開的信息,簡單做一個比較:1、Life:最初的SOLid已退市,讀長較短,70-75,買了PGM,升級版IONProton,主推的產(chǎn)品速度快,用半導體檢測離子電流,綜合成本低于光學檢測,操作簡便。缺點在于穩(wěn)定性和準確性,依賴于實驗條件和水質(zhì)環(huán)境。2、Illumina:份額最大,優(yōu)勢在于市場上通量最高,準確性可以接受,好于life,缺陷在于讀長100-150,在全球形成壟斷狀態(tài),據(jù)說對全球的消耗市場,每年漲價4%,應用成本高。3、華大基因收購CompleteGenomics(簡稱CG):最早不賣測序儀,只是生產(chǎn)設(shè)備,進行測序服務,華大收購后,CG最大優(yōu)勢在于設(shè)備和試劑自產(chǎn),成本可控,通量可根據(jù)生產(chǎn)線擴大而擴大,但技術(shù)上劣勢在于讀長更短,只有10幾到20幾。對數(shù)據(jù)分析影響很大。
總結(jié)
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