人类、果蝇和蛔虫这三种生物的基因组有何区别和差异?
生活随笔
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人类、果蝇和蛔虫这三种生物的基因组有何区别和差异?
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為了研究假基因的潛在功能與基因組進化,Mark B. Gerstein及其同事分析了基因組數據并且組織了人類、線蟲(Caenorhabidis elegans)和果蠅(Drosophila melanogaster)基因組的假基因注釋,這些基因組是由DNA元素百科全書(ENCODE)與模式生物ENCODE項目提供的。這組作者發現,在人類基因組內的這些假基因補充物以加工假基因為主,這是插入到基因組中的信使RNA的拷貝,而假基因的暴發起源于大約在靈長類最初進化出來的時候。相比之下,線蟲和果蠅的假基因補充物主要含有復制的假基因。這組作者說,單個的分類學門可能含有特征性的假基因補充物,能揭示出某些形成基因組的進化過程。此外,這組作者觀察到了這3個門中的大約75%的假基因表現出了某種程度的生物化學活動, 并且具有類似基因的特征,這提示某些假基因可能擁有尚未發現的生物功能;這組作者說,特別是這3個門每個都有大約15%的假基因是轉錄的,這揭示出了這些門的假基因活動的一種可能的相似性。
在最近的一項研究中,研究者們對人、果蠅、蛔蟲這三種物種的基因解讀和染色體組裝進行了詳盡的對比。在轉錄組對比方面,科學家在這三種物種中均發現16個基因表達模塊,這些基因模塊對應于諸如轉錄和細胞分裂這類過程。他們也在這三種物種均發現胚胎發育早期時基因表達的一種相似模式。在核染色質對比方面,他們在這三種物種中均發現許多保守核染色質特征。但他們也在抑制性核染色質的組分和位置上發現明顯差異。研究結果大大豐富了功能基因組數據庫,科學家們可以利用它來發現生物的共同特性,進而更加深入的了解人類基因組中的生物信息如何調節發育和引起疾病。該研究被刊登于8月28日的《Nature》上。
在最近的一項研究中,研究者們對人、果蠅、蛔蟲這三種物種的基因解讀和染色體組裝進行了詳盡的對比。在轉錄組對比方面,科學家在這三種物種中均發現16個基因表達模塊,這些基因模塊對應于諸如轉錄和細胞分裂這類過程。他們也在這三種物種均發現胚胎發育早期時基因表達的一種相似模式。在核染色質對比方面,他們在這三種物種中均發現許多保守核染色質特征。但他們也在抑制性核染色質的組分和位置上發現明顯差異。研究結果大大豐富了功能基因組數據庫,科學家們可以利用它來發現生物的共同特性,進而更加深入的了解人類基因組中的生物信息如何調節發育和引起疾病。該研究被刊登于8月28日的《Nature》上。
總結
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