全基因组测序能否扼制传染病大规模地爆发?
生活随笔
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全基因组测序能否扼制传染病大规模地爆发?
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
這個(gè)暫時(shí)還是難以實(shí)現(xiàn)的。全基因組測(cè)序的準(zhǔn)確率很高,但個(gè)人覺(jué)得扼制傳染病大規(guī)模地爆發(fā)不太可能,在實(shí)現(xiàn)上難度想當(dāng)大。首先,既然是傳染病,想要扼制大規(guī)模地爆發(fā),就得遏制每一個(gè)人的生病,因?yàn)橐稽c(diǎn)有一個(gè)人生病,那就不受基因控制了,傳染是必然的。其次,要從基因?qū)用嫔蠈?shí)現(xiàn)每一個(gè)人的控制,現(xiàn)在聽(tīng)起來(lái)像是天方夜譚。
2011年底,英國(guó)一家醫(yī)院的多名嬰兒被耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)感染。隨后,Wellcome Trust Sanger研究院的一個(gè)研究小組開(kāi)始分析這些病例的樣本。想要確定,這些感染是否構(gòu)成了爆發(fā)。總的來(lái)說(shuō),醫(yī)院的數(shù)據(jù)不是那么明確;病例傳播的時(shí)間軸上存在缺口,讓人難以下結(jié)論過(guò)去六個(gè)月內(nèi)是否存在爆發(fā)。醫(yī)生們于是聯(lián)系了研究小組。此時(shí),新的病例突然出現(xiàn)在同一病房中。 研究小組分析了新的MRSA樣本,確認(rèn)新病例屬于原先爆發(fā)的一部分。使用了高分辨率的基因組測(cè)序技術(shù),研究人員能夠告訴醫(yī)生,盡管傳播的時(shí)間軸上有缺口,但醫(yī)院中的所有MRSA菌株都是相關(guān)的。此外,數(shù)據(jù)表明這是個(gè)內(nèi)部問(wèn)題,一名工作人員很有可能充當(dāng)了MRSA傳染的攜帶者。于是,他們對(duì)150名工作人員進(jìn)行采樣并測(cè)序。在發(fā)表于《柳葉刀-傳染病》的文章中,研究人員確定一名醫(yī)護(hù)人員為攜帶者1。此人被隔離、治療,后重返工作崗位。自此,醫(yī)院再?zèng)]有MRSA感染。這是基因組測(cè)序首次被實(shí)時(shí)應(yīng)用,來(lái)干預(yù)傳染病爆發(fā)。若沒(méi)有測(cè)序,一個(gè)新病例不足以讓我們采取行動(dòng)。因?yàn)镈NA測(cè)序?qū)⒈怀R?guī)使用,所以便能搞清楚這些耐藥細(xì)菌的爆發(fā)。
全基因組測(cè)序?qū)τ陂_(kāi)發(fā)傳染病對(duì)抗藥物是有幫助的,如:抗埃博拉病毒(Ebola)藥物。但由于這類(lèi)病毒的變異性特別強(qiáng),所以先前測(cè)得的全基因組數(shù)據(jù)可能在病毒變異后用處大大降低,所以只依靠基因測(cè)序技術(shù)顯然不能阻止大規(guī)模傳染病爆發(fā)。
2011年底,英國(guó)一家醫(yī)院的多名嬰兒被耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)感染。隨后,Wellcome Trust Sanger研究院的一個(gè)研究小組開(kāi)始分析這些病例的樣本。想要確定,這些感染是否構(gòu)成了爆發(fā)。總的來(lái)說(shuō),醫(yī)院的數(shù)據(jù)不是那么明確;病例傳播的時(shí)間軸上存在缺口,讓人難以下結(jié)論過(guò)去六個(gè)月內(nèi)是否存在爆發(fā)。醫(yī)生們于是聯(lián)系了研究小組。此時(shí),新的病例突然出現(xiàn)在同一病房中。 研究小組分析了新的MRSA樣本,確認(rèn)新病例屬于原先爆發(fā)的一部分。使用了高分辨率的基因組測(cè)序技術(shù),研究人員能夠告訴醫(yī)生,盡管傳播的時(shí)間軸上有缺口,但醫(yī)院中的所有MRSA菌株都是相關(guān)的。此外,數(shù)據(jù)表明這是個(gè)內(nèi)部問(wèn)題,一名工作人員很有可能充當(dāng)了MRSA傳染的攜帶者。于是,他們對(duì)150名工作人員進(jìn)行采樣并測(cè)序。在發(fā)表于《柳葉刀-傳染病》的文章中,研究人員確定一名醫(yī)護(hù)人員為攜帶者1。此人被隔離、治療,后重返工作崗位。自此,醫(yī)院再?zèng)]有MRSA感染。這是基因組測(cè)序首次被實(shí)時(shí)應(yīng)用,來(lái)干預(yù)傳染病爆發(fā)。若沒(méi)有測(cè)序,一個(gè)新病例不足以讓我們采取行動(dòng)。因?yàn)镈NA測(cè)序?qū)⒈怀R?guī)使用,所以便能搞清楚這些耐藥細(xì)菌的爆發(fā)。
全基因組測(cè)序?qū)τ陂_(kāi)發(fā)傳染病對(duì)抗藥物是有幫助的,如:抗埃博拉病毒(Ebola)藥物。但由于這類(lèi)病毒的變異性特別強(qiáng),所以先前測(cè)得的全基因組數(shù)據(jù)可能在病毒變異后用處大大降低,所以只依靠基因測(cè)序技術(shù)顯然不能阻止大規(guī)模傳染病爆發(fā)。
總結(jié)
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