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RNA测序可靠性如何?

發布時間:2023/11/24 万象百科 55 博士
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 RNA测序可靠性如何? 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
RNA測序也就是所謂的RNA-seq,通常指的是轉錄組測序,只測細胞中的轉錄本,只有基因組中被轉錄出來的那部分能測到,通常用于尋找差異表達基因以及發現新基因。DNA測序是測基因組,不管轉錄不轉錄,通常用于基因組組裝,重測序進行基因分型等。相對而言,RNA測序影響準確度的因素要多一些。

DNA測序是將RNA反轉錄成DNA然后測序,在反轉錄的過程中會存在一定小概率的錯配、缺失等。 轉錄組測序主要通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉錄出來的mRNA。

最近,由美國FDA牽頭的測序質量控制(SEQC)項目對RNA測序的準確性、可重現性和信息含量進行了綜合性評估,并將初步調查結果發表在近日的Nature Biotechnology雜志上。研究人員發現,所有測序深度都會出現未注釋的外顯子-外顯子連接區域,其中80%以上都得到了qPCR的驗證。用RNA測序檢測相對表達可以得到準確且可重復的結果,但RNA測序和芯片都不能提供精確的絕對測量,而且研究用到的平臺都存在基因特異性的偏好,包括qPCR。數據分析的算法也會對RNA測序產生很大影響,不同算法生成的轉錄本數據差異很大。

整體來說還是可靠的,雖說會有些許錯配但是不會太影響。如果與DNA測序相比,還是有所不如的~

總結

以上是生活随笔為你收集整理的RNA测序可靠性如何?的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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