单细胞分析,样品如何制备呢?
生活随笔
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单细胞分析,样品如何制备呢?
小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
這個(gè)關(guān)鍵步驟是單細(xì)胞的分離,Quake曾使用微流體方法來分離一種稱為TM7的無法培養(yǎng)微生物1。TM7是桿狀的,于是Quake及其團(tuán)隊(duì)專門捕獲口腔微生物群落中的桿狀細(xì)菌。隨后他們通過核糖體RNA來追蹤所要的細(xì)胞。在35個(gè)分離的桿狀細(xì)菌中,4個(gè)都證明是TM7,他們對(duì)其中一個(gè)進(jìn)行測序。Woyke認(rèn)為,微流體方法有兩個(gè)主要優(yōu)勢。第一,用戶能夠觀察他們正在分離的細(xì)胞,這讓他們能夠選擇特定的形態(tài)或表型,并將此信息與基因型相關(guān)聯(lián)。第二是擴(kuò)增效率。單拷貝的細(xì)菌基因組顯然不夠用來測序,因此需要全基因組擴(kuò)增。但并非所有片段都能同等擴(kuò)增,一些可能會(huì)丟失?!耙恍┭芯勘砻?,如果反應(yīng)體積越小,那么單細(xì)胞基因組的回收就越好,覆蓋也更加均一,”Woyke說。http://www.ebiotrade.com/newsf ... 4.htm
樓主有興趣可以參考一下文獻(xiàn),介紹了幾種常用的方法,挺詳細(xì)的,問題是幾種方法各有優(yōu)缺點(diǎn),所以樓主可根據(jù)自己的需求進(jìn)行選擇,對(duì)于單細(xì)胞基因組學(xué)的研究還是比較熱門,而分離技術(shù)可能是限制其發(fā)展的瓶頸之一,如果其他大牛有更好的方法,不妨共享一下哈。單細(xì)胞分析 樣品制備
樓主有興趣可以參考一下文獻(xiàn),介紹了幾種常用的方法,挺詳細(xì)的,問題是幾種方法各有優(yōu)缺點(diǎn),所以樓主可根據(jù)自己的需求進(jìn)行選擇,對(duì)于單細(xì)胞基因組學(xué)的研究還是比較熱門,而分離技術(shù)可能是限制其發(fā)展的瓶頸之一,如果其他大牛有更好的方法,不妨共享一下哈。單細(xì)胞分析 樣品制備
總結(jié)
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