人重测序分析的对比库选择哪个呢?
生活随笔
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人重测序分析的对比库选择哪个呢?
小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
現(xiàn)在已經(jīng)測出的人類基因組的數(shù)量,保守估計(jì)都應(yīng)該在十萬以上;當(dāng)然也會保存在不同的數(shù)據(jù)庫中,可能同一個(gè)樣本的數(shù)據(jù)也會存儲在不同的數(shù)據(jù)庫中,除了樓主表述的之外,現(xiàn)在比較常用的還有日本的DJJB,另外我們中國的基因庫也已經(jīng)上線運(yùn)行了,樓主可以關(guān)注下;至于在科學(xué)研究中,用哪個(gè)參考基因組,有兩種情況,如果沒有指定,那就選擇NCBI中最常用的那個(gè)就行了;如果你用的某個(gè)細(xì)胞系做實(shí)驗(yàn),最好選用它已經(jīng)發(fā)表的基因組數(shù)據(jù);如果中國人進(jìn)行重測序時(shí),用炎黃一號基因組應(yīng)該沒錯(cuò)的~
總結(jié)
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