HiSeq X Ten测序的结果可靠性如何?
生活随笔
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HiSeq X Ten测序的结果可靠性如何?
小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
從我了解的情況來看,該測(cè)序平臺(tái)的可靠性是較高的,在建庫成功的情況下,其測(cè)序質(zhì)量完全滿足科研需要。,目前NEB建庫沒有問題,index分?jǐn)?shù)據(jù)也沒有問題。數(shù)據(jù)質(zhì)量很不錯(cuò)。北京諾禾致源生物信息科技公司2014年6月19日和6月03日,已經(jīng)對(duì)首批人重測(cè)序試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行了公開。在諾禾致源下機(jī)的第一批人類樣本結(jié)果顯示:該平臺(tái)在堿基準(zhǔn)確度、測(cè)序均一性、可用數(shù)據(jù)比例、測(cè)序深度及覆蓋度等方面均表現(xiàn)優(yōu)異,與上一代主流測(cè)序儀HiSeq2000旗鼓相當(dāng),而測(cè)序通量大大提升。其中,單張F(tuán)lowcell 的數(shù)據(jù)產(chǎn)出達(dá)到了943.2 G,數(shù)據(jù)質(zhì)量Q20 > 95%,Q30 > 88%,平均GC含量為43.6%。具體結(jié)果見鏈接:國(guó)內(nèi)首批HiSeq X Ten人類樣本測(cè)序結(jié)果大公開中國(guó)首批HiSeq X Ten測(cè)序測(cè)試結(jié)果發(fā)布隨著儀器的穩(wěn)定性在運(yùn)行過程中進(jìn)一步穩(wěn)定和試劑的改進(jìn)、實(shí)驗(yàn)人員經(jīng)驗(yàn)的積累,測(cè)序質(zhì)量應(yīng)該會(huì)進(jìn)一步提高。
本人認(rèn)為可靠性還是比較高的。只要測(cè)序公司在運(yùn)用HiSeq X Ten平臺(tái)時(shí),在堿基準(zhǔn)確度、測(cè)序均一性、可用數(shù)據(jù)比例方面的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)達(dá)到甚至超過Illumina官方提供的參考標(biāo)準(zhǔn),基本上不會(huì)存在什么問題。HiSeq X 能夠在三天時(shí)間內(nèi)生成 1.8 terabases 的數(shù)據(jù),相當(dāng)于 16 個(gè)人類基因組。據(jù) Illumina 介紹,每臺(tái) HiSeq X Ten 每年將能夠測(cè)序 18,000 個(gè)人類基因組。每個(gè)基因組都能夠達(dá)到覆蓋度 30x 的金標(biāo)準(zhǔn),這意味著每個(gè)堿基平均被讀取 30 次。
本人認(rèn)為可靠性還是比較高的。只要測(cè)序公司在運(yùn)用HiSeq X Ten平臺(tái)時(shí),在堿基準(zhǔn)確度、測(cè)序均一性、可用數(shù)據(jù)比例方面的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)達(dá)到甚至超過Illumina官方提供的參考標(biāo)準(zhǔn),基本上不會(huì)存在什么問題。HiSeq X 能夠在三天時(shí)間內(nèi)生成 1.8 terabases 的數(shù)據(jù),相當(dāng)于 16 個(gè)人類基因組。據(jù) Illumina 介紹,每臺(tái) HiSeq X Ten 每年將能夠測(cè)序 18,000 個(gè)人類基因組。每個(gè)基因組都能夠達(dá)到覆蓋度 30x 的金標(biāo)準(zhǔn),這意味著每個(gè)堿基平均被讀取 30 次。
總結(jié)
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