GCG可以的，還有linux 下的TIGR Assembler和Phrap都可以進行全基因組數據的組裝。 　　新一代測序技術的出現為生命科學重大問題研究提供新的手段的同時，其海量數據及其長度短、精度相對較低等特點，為生物信息學設置了前所未有的時代挑戰。海量reads數據的處理能力遠遠落后于測序數據的爆炸性增長速度，測試數據的快速、準確分析已經成為生命科學研究的短板新一代測序技術的出現為生命科學重大問題研究提供新的手段的同時，其海量數據及其長度短、精度相對較低等特點，為生物信息學設置了前所未有的時代挑戰。海量reads數據的處理能力遠遠落后于測序數據的爆炸性增長速度，測試數據的快速、準確分析已經成為生命科學研究的短板新一代測序技術的出現為生命科學重大問題研究提供新的手段的同時，其海量數據及其長度短、精度相對較低等特點，為生物信息學設置了前所未有的時代挑戰。海量reads數據的處理能力遠遠落后于測序數據的爆炸性增長速度，測試數據的快速、準確分析已經成為生命科學研究的短板基因組學最困難問題之一是如何由短的DNA片段組裝成完整的基因組。1月10日發表在美國《國家科學院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)上的一項研究中，由多個學科的研究人員組成的研究小組解決了這個問題，他們建立的算法能在沒有基因組是如何組織這一先決信息的條件下迅速預測其基因組組成。　　二代測試(Next generation sequencing，NGS)技術已發展了15年，其創造了數以千計的NGS小片段，在物種基因組已被廣泛研究的條件下，現有的信息可用于組裝這些小片段，就像是用一個完整的畫面作為拼圖游戲的指導。但是對于那些較少研究的物種，用小片段組裝基因組會變得非常困難。該研究小組用已知的一個或多個物種的基因組，結合待測物種的NGS片段進行組裝，預測其基因組序列。這是首次不需要基因組遺傳圖譜或物理圖譜的幫助下利用NGS數據組裝整個染色體基因組。該算法對大規模測序項目非常有用，如對1萬種脊椎動物基因組測序的G10K項目，其測序對象大多沒有遺傳圖譜。　　這種算法稱為參考基因組輔助染色體裝配(Reference-assisted chromosome assembly，RACA)，其相應的軟件用模擬數據，規范的參考基因組數據和由華大基因(BGI)新測序的藏羚羊基因組進行評估，證實基因組的預測是非常準確的。當NGS技術產生更長的DNA片段時，RACA算法會表現得更好。　　最新一代的測序儀的全基因組組裝也是一個難題，尤其是復雜的基因組，RACA預測算法可解決這一難題，并可被納入當前NGS序列組裝分析的流程中。

有一種算法稱為參考基因組輔助染色體裝配（Reference-assisted chromosome assembly，RACA），其相應的軟件用模擬數據，規范的參考基因組數據和由華大基因（BGI）新測序的藏羚羊基因組進行評估，證實基因組的預測是非常準確的。當NGS技術產生更長的DNA片段時，RACA算法會表現得更好。具體的原理不是很懂，等高人來答。。。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的全基因组数据组装用主要用何种技术实现？的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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