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lempel ziv matlab,基于Python的LempelZiv算法的熵估计

發布時間:2023/12/1 41 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 lempel ziv matlab,基于Python的LempelZiv算法的熵估计 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

此函數允許估計時間序列的熵。它基于Lempel-Ziv壓縮算法。對于長度為n的時間序列,熵估計為:

E=(1/n和L_i)^-1 ln(n)

式中,L逯i是從位置i開始的最短子串的長度,該子串之前沒有從位置1出現到i-1。當n接近無窮大時,估計的熵收斂到時間序列的實熵。在

我想用Python實現is,我是這樣做的:def contains(small, big):

for i in range(len(big)-len(small)+1):

if big[i:i+len(small)] == small:

return True

return False

def actual_entropy(l):

n = len(l)

sequence = [l[0]]

sum_gamma = 0

for i in range(1, n):

for j in range(i+1, n+1):

s = l[i:j]

if contains(s, sequence) != True:

sum_gamma += len(s)

sequence.append(l[i])

break

ae = 1 / (sum_gamma / n ) * math.log(n)

return ae

但是,我發現當數據越來越大時,它的計算速度太慢了。例如,我使用了一個包含23832個元素的列表作為輸入,所消耗的時間如下:(data can be foundhere)

^{pr2}$

我有成千上萬的這樣的名單要計算,這么長的時間是無法忍受的。我應該如何優化此功能并使其更快地工作?在

總結

以上是生活随笔為你收集整理的lempel ziv matlab,基于Python的LempelZiv算法的熵估计的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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