人工智能应用于心电图:这6篇论文值得收藏
心電圖(ECG)是一種測量心臟電活動的常規(guī)方法,用于檢測和診斷心臟疾病,在日常體檢中也是必要的檢查項目。醫(yī)生會記住心電圖的正常參考值,了解異常心電圖的特征表現(xiàn),現(xiàn)在已經(jīng)形成了標準的心電分析流程,在醫(yī)院院內(nèi)心血管診療中發(fā)揮重要作用。
心電輔助系統(tǒng)的研究開始于20世紀50年代,目前有多個成熟的商用系統(tǒng)。但是如果增加心臟收縮舒張的監(jiān)測時間,隨之產(chǎn)生的心電圖數(shù)據(jù)越來越多,如何利讓機器用算法抓住其中的規(guī)律為疾病診斷提供依據(jù)?人工智能的算法在語音、圖像領(lǐng)域提取規(guī)律取得了非常好的成績,因此將人工智能算法應(yīng)用于心電領(lǐng)域是值得好好探索的方向。由吳恩達領(lǐng)導(dǎo)的斯坦福大學(xué)機器學(xué)習小組,早在2017年的一篇論文研發(fā)出一種新的深度學(xué)習算法,分析心電圖數(shù)據(jù)可以診斷14種類型的心律失常。?
這里需要補充一下背景知識,心電是電壓信號,單導(dǎo)聯(lián)心電可用于節(jié)律類的心臟診斷,如心律不齊,多導(dǎo)聯(lián)的心電可以做更復(fù)雜的診斷。心電的原理是心肌細胞去極化的時候會在皮膚表面引起很小的電學(xué)改變,這種電壓差的連續(xù)變化反映了心臟收縮舒張的過程[1]。
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第一篇:十年心電圖分析大總結(jié)
心電圖信號基本上與心臟的電活動(electrical activity)相對應(yīng)。心電圖信號被用于各種用途,如測量心率、檢查心跳節(jié)律、診斷心臟異常、情感識別和生物特征識別。心電圖分析可以包含幾個步驟,如預(yù)處理、特征提取、特征選擇、特征轉(zhuǎn)換和分類。為了進行相關(guān)的分析,每個步驟的執(zhí)行都是至關(guān)重要的。此外,采用適當措施和心電信號數(shù)據(jù)庫也在分析中發(fā)揮著重要作用。在本研究中,基于以上主要方面,對近十年來有關(guān)心電圖分析的文獻進行了全面的綜述。簡述了心電圖分析的各個步驟,并提供了相關(guān)研究。
論文信息:"A survey on ECG analysis."?Biomedical Signal Processing and Control?43 (2018): 216-235.
?第二篇:用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進行心臟病專家級的心律不齊檢測
吳恩達團隊和可穿戴心電圖監(jiān)測設(shè)備廠商iRhythm合作,收集并標注了來自29163名患者的64121份心電圖數(shù)據(jù),以200 Hz的頻率采樣,構(gòu)建了大規(guī)模的訓(xùn)練集和校驗集,用來訓(xùn)練神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。他們又從328名患者處收集了336份心電圖數(shù)據(jù),構(gòu)成了測試集。數(shù)據(jù)集中的心電圖樣本每段30秒,都經(jīng)過專業(yè)醫(yī)生標注。測試集的數(shù)據(jù)標注則經(jīng)過3名心臟病專家組成的委員會共同判斷得出。構(gòu)建了34層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),包括33個卷積層、一個全連接層和softmax模型,以原始心電圖時間序列為輸入,每秒輸出一次預(yù)測標簽。論文的主要作者說:“心律信號之間的差異可能非常細微,比如說,有兩種心律不齊都叫做二度房室傳導(dǎo)阻滯的,它們在心電圖上的表現(xiàn)也非常相似,但一種需要立刻治療,一種不需要。”而這篇論文用深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),從心電圖中識別14類心律不齊。
論文信息:"Cardiologist-level arrhythmia detection and classification in ambulatory electrocardiograms using a deep neural network."?Nature Medicine?25.1 (2019): 65.?
?第三篇:使用人工智能心電圖檢查心臟收縮功能障礙
心電數(shù)據(jù)易獲取、成本低,能否成為無癥狀的左心室功能障礙(ALVD)的早篩工具?
無癥狀的左心室功能障礙存在于普通人群的比率是3%-6%,即使可以治療,該病會降低患者生活質(zhì)量和減少壽命。目前還沒有用于該病低成本的,無創(chuàng)的篩查工具。
我們測試了這樣的假設(shè):對來自美國梅奧診所(Mayo Clinic)的44959名患者使用一種常規(guī)的測量心臟電活動的方法,收集成對的12導(dǎo)聯(lián)心電圖和超聲心動圖數(shù)據(jù),包括左心室射血分數(shù)(衡量收縮功能),我們訓(xùn)練了一個卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),以確定患有心室功能障礙的患者,射出分率(ejection fractio)≤ 35%,并僅使用心電圖數(shù)據(jù)。當在一組獨立的52870名患者上進行測試時,網(wǎng)絡(luò)模型得出曲線下面積的值,敏感性,特異性和準確度分別為0.93和86.3%,85.7%和85.7%。
在沒有心室功能障礙的患者中,人工智能篩查呈陽性的患者未來發(fā)生心室功能障礙的風險是其他患者4倍(風險比4.1;95%置信區(qū)間,3.3 to 5.0)。將人工智能算法應(yīng)用于心電圖,能夠?qū)崿F(xiàn)一個長期監(jiān)測的低成本功能,允許心電圖作為沒有癥狀個體的強大篩查工具來識別該病。
論文:"Screening for cardiac contractile dysfunction using an artificial intelligence–enabled electrocardiogram."?Nature Medicine?25.1 (2019): 70.
第四篇:區(qū)域聚集網(wǎng)絡(luò),改進卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)用于心電圖特征檢測
心電圖特征點的提取是心電圖自動分析技術(shù)的第一步。論文提出了一種新的端到端深度學(xué)習方法——區(qū)域匯聚網(wǎng)絡(luò)(RAN),用于心電圖特征點的檢測。
采用1D卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)對心電圖信號進行自動處理。提出了一種新的區(qū)域聚集策略來代替?zhèn)鹘y(tǒng)的全連通層作為回歸器。論文團隊為公共心電圖數(shù)據(jù)庫提供了可靠和準確的檢測性能。該方法在QT數(shù)據(jù)庫上的評價結(jié)果表明,該方法的檢測精度與國內(nèi)先進的檢測方法具有可比性。實驗證明,深度學(xué)習方法是一種有效的心電信號分析方法。
論文信息:"Region Aggregation Network: Improving Convolutional Neural Network for ECG Characteristic Detection."?. IEEE
第五篇:基于遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和主動學(xué)習的全局可更新心電圖心跳分類系統(tǒng)
該系統(tǒng)通過單一分類器為所有患者實現(xiàn)了最先進的性能。論文所提出的優(yōu)化機制顯著提高了整個系統(tǒng)的泛化能力。實施遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)以自動學(xué)習特征。通過心電圖(ECG)自動診斷心律失常所面臨的主要挑戰(zhàn)是個體患者之間的巨大差異以及標記臨床心電圖記錄的高成本。為了建立具有自動特征學(xué)習方案和有效優(yōu)化機制的系統(tǒng),我們提出了一種全局可更新的分類方案,稱為全局遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(GRNN)。基于形態(tài)學(xué)和時間信息,采用遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來探索心電圖搏動的基本特征。為了在獲得新樣本時提高系統(tǒng)性能,應(yīng)用主動學(xué)習來選擇信息量最大的節(jié)拍并將其合并到訓(xùn)練集中。隨著訓(xùn)練集的增長,系統(tǒng)會更新。論文提出的全局遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)有三項主要創(chuàng)新。首先,依靠全局遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的大容量和擬合能力,我們可以用單一模型對多個不同患者的樣本進行分類。其次,當訓(xùn)練樣本和測試樣本來自不同的數(shù)據(jù)庫時,全局遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)提高了泛化性能。這可以解釋為優(yōu)化機制找到最具信息性的樣本以改善作為訓(xùn)練數(shù)據(jù)的性能。最后,遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)自動學(xué)習來自不同類別的樣本之間的潛在差異。實驗結(jié)果證明全局遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)通過單一模型實現(xiàn)了最先進的性能。在數(shù)據(jù)庫實驗中,訓(xùn)練數(shù)據(jù)和測試數(shù)據(jù)分別來自不同的數(shù)據(jù)庫,與其他算法相比,全局遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)實現(xiàn)了顯著的改進。 ?
論文信息:"A global and updatable ECG beat classification system based on recurrent neural networks and active learning."?Information Sciences?(2018).
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第六篇:用深層網(wǎng)絡(luò)對心律失常進行注釋的方法
本研究旨在利用深度網(wǎng)絡(luò)對心律失常進行自動標注。研究類型包括竇性心律、心律失常、室上性心動過速、心室顫動或纖顫、室性心動過速。方法:將麻省理工學(xué)院惡性心室性心律失常數(shù)據(jù)庫和麻省理工學(xué)院正常竇性心律數(shù)據(jù)庫中的13s肢體導(dǎo)聯(lián)心電圖塊分成子集,進行5次交叉驗證。將這些信號重新采樣到200Hz,濾除基線漂移,投影到二維灰度譜中,然后送入一個全新結(jié)構(gòu)的深層網(wǎng)絡(luò)。
該網(wǎng)絡(luò)利用殘差層提取單個時間點的特征向量,利用變分自動編碼器(VAE)提取隱式表示。在訓(xùn)練過程中,將這些前半部分訓(xùn)練到損失函數(shù)的某一閾值,然后在訓(xùn)練過程中切換到剩余的雙向遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(RNN),即預(yù)測心律失常類別的前半部分。經(jīng)過訓(xùn)練的模型進入到容器的映像中,以便在終端或云端中部署。結(jié)論:對四種心律失常均有良好的敏感性和較好的準確率。在兩個心室心律失常也被觀察到了。此外,用變分自動編碼器進行隱式表示,可以顯著提高算法的收斂速度和精度。
論文信息:"Method to Annotate Arrhythmias by Deep Network."?arXiv preprint arXiv:1806.07715?(2018).
編者注:
[1] Electrophysiology, Task Force of the European Society of Cardiology the North American Society of Pacing. "Heart rate variability: standards of measurement, physiological interpretation, and clinical use." Circulation 93.5 (1996): 1043-1065.
親愛的數(shù)據(jù)
出品:譚婧
美編:陳泓宇
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總結(jié)
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