分子模拟软件amber_容天AMBER优化的GPU解决方案
AMBER認證的GPU系統
AMBER認證GPU系統提供商容天更快地運行MD仿真
容天與AMBER的主要開發商合作開發了交鑰匙解決方案，為GPU加速的生物分子模擬提供增值系統。
經過驗證的系統，每個用戶的CPU，GPU，內存和存儲具有適當的平衡。
從工作站到超級計算機的高度可擴展系統，具有3年保修和支持。
容天 AMBER優化的GPU加速系統
更快地完成MD仿真并不需要花費很多。我們的AMBER GPU工作站性價比極高。
加速Amber MD
最新的GPU硬件具有Tesla A100 、V100S、Quadro RTX 8000等，可運行更快的AMBER MD仿真。
預配置
通過示例作業提交腳本，基準測試，經過全面驗證的測試套件以及最新的軟件補丁，可以快速實施。
即插即用
容天系統是完全交鑰匙的，可以直接使用，因此可以避免配置和設置的麻煩。
用于分子動力學的AMBER GPU系統
找到最適合您的需求
MD專用GPU工作站 | 雙Intel Xeon性能 | 高端仿真工作站 |
SCW4000-G2 | SCW4150-G2 | SCW4350-G2 |
1個Intel Xeon 可擴展 | 2個Intel Xeon可擴展(金牌) | 2個Intel Xeon可擴展(金牌) |
2個NVIDIA Geforce/Quatro | 2個NVIDIA Geforce/Quatro | 4個NVIDIA Geforce/Quatro |
4個16GB內存 | 12個16GB內存 | 12個32GB內存 |
1個512GB SSD(OS) 一個4TB HDD(數據) | 1個512GB SSD(OS) 1個8TB HDD(數據) | 1個512GB SSD(OS) 1個8TB HDD(數據) |
適用于小型仿真的預算友好型系統。 | 雙處理器工作站，用于更復雜的仿真。 | 高端處理器和內存配置可提供出色的性能。 |
借助容天系統提高AMBER 18性能來看到差異
顯式溶劑PME基準
?DHFR NVE HMR 4fs
?DHFR NPT HMR 4fs
?DHFR NVE 2fs
?DHFR NPT 2fs
?STMV NPT HMR 4fs
?FactorIX NVE
?FactorIX NPT
?Cellulose NVE
?Cellulose NPT
隱式溶劑GB基準
?TRPCage
?Myoglobin
?Nucleosome
容天系統中可用的AMBER 18
AMBER18軟件包通過添加pmemd程序在AmberTools18上構建，該程序類似于AmberTools中的sander(分子動力學)代碼，但在多個CPU上提供了更好的性能，并在GPU上顯著提高了速度。
主要的新功能包括
GPU上的自由能計算
GPU支持12-6-4離子電勢
CPU并行性的域分解
用于pmemd的微調彈性帶計算(CPU和部分GPU實施)
恒定的氧化還原電位計算，以補充恒定的pH模擬
支持和支持NVIDIA最新的Maxwell，Pascal和Volta ? ? GPU。
適用于先進力場(包括AMOEBA)的新pmemd.gem代碼
容天 AMBER認證的GPU系統
開發AMBER GPU的主要推動力是以經濟的價格，高的能效以及可讓最廣泛的研究人員受益的系統，將超級計算機的功能和性能帶入單個臺式機。容天與AMBER開發團隊合作，設計了一系列AMBER GPU計算解決方案，為AMBER用戶提供最佳的價格性能。
所有容天 AMBER系統都預裝了最新版本和更新。每個系統都是完全交鑰匙的，可以立即使用，并提供有保證的性能。這為科學家提供了一種解決方案，以獲取用于運行GPU AMBER(以及常規CPU AMBER仿真)的最佳工作站和群集。
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