生物數據庫除核酸和蛋白質還有一些專用數據庫。

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當你明確研究對象，應盡可能多的尋找并閱讀相關文獻。

文獻數據庫

PubMed數據庫

Pubmed是互聯網最著名的免費Medline數據庫，由NLM的生物信息技術中心（NCBI）提供。

pubmed數據源：

• MEDLINE indexed：主體、標有主題詞（MeSH，medical subject headings，醫學主題詞）、文獻類型等字段。
• OldMEDLINE：1950-1965年間的美國醫學索引（IM）中的題錄（無文摘），約200萬篇，逐漸并入MEDLINE主庫。
• In-process citation：臨時庫，收錄準備進行標引的題錄和文摘信息，動態更新，標引主題詞等字段后進入Medline。
• Publisher-Supplied Citations：出版商提供的所有文獻，包括非Medline收錄范圍文獻。

疾病相關數據庫

隨著生物醫學研究的深入，科學家們已經認識到人類的疾病或多或少、直接或者間接的與基因存在某種關系，即使是外傷、中毒或者感染，都與個人的免疫能力有關，而免疫能力也是與基因相關的。可以認為人類疾病都是廣義的“基因病”。

基因病可以分為單基因病，多基因病，染色體病以及獲得性基因病。

單基因病：遺傳受一對等位基因控制。

多基因病：發生取決于多個基因的聯合作用。

染色體病：染色體數目和結構異常所導致，

獲得性基因病：病原微生物通過感染將其基因侵入宿主基因導致。

尋找人類遺傳疾病基因主要由三種策略：

• 功能克隆

從表型異常出發，找出異常功能蛋白，根據氨基酸序列推導出編碼核苷酸序列，以此為探針在基因組文庫或cDNA文庫中篩選目的基因或cDNA。

• 定位克隆

根據目的基因在染色體上的位置進行基因分離，即通過分析突變位點與已知分子標記的連鎖關系確定突變基因在染色體上的位置。

• 定位候選克隆

定位候選克隆包括三個基本步驟：基因組定位、候選cDNA的獲得、全長及功能分析。

定位候選克隆依賴于大量數據的支持。

人類孟德爾遺傳數據庫（OMIM）

人類孟德爾遺傳數據庫是將遺傳病分類并鏈接到相關人類基因組中的數據。

數據庫中數據來源于各種生物醫學文獻，經人工篩選鑒定，寫入數據庫條目。

需要說明的是，OMIM并沒有囊括所有遺傳病，主要包含的是以孟德爾方式遺傳的人類基因與遺傳病的記錄，并未涉及染色體失常引起的疾病，復雜性疾病的信息也收集得較少。

代謝相關數據庫

代謝途徑是生物體內基因由轉錄并翻譯成蛋白質后參與的，物質通過酶促反應轉變為其他物質的路徑。

KEGG數據庫

京都基因與基因組百科全書是關于基因，蛋白質，生化反應以及通路的綜合性生物信息數據庫，由多個子庫構成。

術語數據庫

對數據進行檢索最準確的檢索詞是數據庫的訪問號或ID號，但不便于記憶，但在以前基因等各種名稱并不統一，所以檢索很不便。所以產生術語數據庫對名稱進行規范化和標準化。

Go語句數據庫

Go是一套在不斷動態更新的控制詞匯，主要用來解釋真核生物基因或蛋白質在細胞內扮演的角色及生物醫學方面的知識。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的生物信息学_分子数据库（四）其他数据库的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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