https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsa/

? ? ? ? ?https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?###TSA提交流程

? ? ? ? ?https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tbl2asn2/? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ###

? ? ? ???ftp://ftp.ncbi.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/converters/by_program/tbl2asn/ ? ? ? ? ?###tbl2asn工具下載頁面，有win,linux版本

? ? ? ? ?https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK53709/#gbankquickstart.Submission_using_tbl2asn

? ? ? ? ?https://wenku.baidu.com/view/1fac238f4431b90d6d85c750.html

? ? ? ? ?http://downloads.asperasoft.com/

1、SUBMITTER

? ? ? 提交者的一些信息

2、GENE INFO

? ? ?1):bioproject ? ? ? ? ??PRJNA395283

? ? ? 2):biosample ? ? ? ??SAMN07374786 ??SAMN07374806?

? ? ?3):SRA run accession

? ? ? ? ? ?SRR5877206,SRR5877205,

? ? ? ? ? ?SRR5877204,SRR5877203

? ? ? 4):assembly metadata

? ? ? ? ? assembly method ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? #組裝方法

? ? ? ? ? version or data program was run ? ? #版本

? ? ? ? ? description of?assembly method ? ? ?#組裝方法描述

? ? ? ? ? sequencing technology ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?#測序平臺

3、FILE ? ? ??

? ? ? ? file type (默認)

? ? ? ?TSA submitter guide ? ? ? #進入界面鏈接

? ? ? ? ? ? ? ? ?structured comment template ? ? ? ? ? #填寫組裝結構信息并下載 ? ?assembly.cmt ? ? ? ? ? https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/structcomment/nongenomes/

? ? ? ? ? ? ? ? ?template.stb ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? #聯系人和數據所有者并下載 ??template.sbt ? ? ? ? ? ?https://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/template.cgi

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Reference?title（文章） ? ： ? ? ??

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Publication?status：A.Unpublished???B.In-press???C.Published

?

4、SEQUENCE

? ? ? ? ? 上傳*.sqn文件

? ? ? ? ??tbl2asn -t *.sbt -i *.fa -w *.cmt -M t -a s -j "[organism=...][moltype=mRNA][SRA=SRR...,SRR...][tech=TSA]" ??具體參數根據實際情況填寫,所給文件名一定要與文件夾中文件名字一致，且不能有空格，空格用_代替。

? ? ? ? ?

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的15、TSA数据上传（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide/#SP）的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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