高斯(Gaussian)軟件的安裝方法

相對于其他的計算軟件，高斯軟件的安裝應該算是最簡單了。

首先下載到高斯的軟件包，然后解壓，最后配置環境變量就可以使用了。

高斯分為 03版本和09版本，每個版本還有小版本號，例如；A01,B01,C01,D01,E01等等。

linux下的版本，一般壓縮包的格式無非就是這么幾種，tar，gz，tgz，tar.bz2,tar.gz,根據相應的命令進行解壓就可以了。

tar?????解壓命令，tar?-xf??XXXX.tar

gz?????解壓命令，tar?-zxf??XXXX.gz

tgz?????解壓命令，tar?-xf??XXXX.tgz

tar.bz2?解壓命令，tar?-jxvf?XXXX.tar.bz2

tar.gz??解壓命令，tar?-zxvf?XXXX.tar.gz

例如：g09_linux_x64_D01.tar.bz2 ，個人習慣，修改文件名稱，下面進行操作安裝

[dlqc@cluster soft]$ mv g09_linux_x64_D01.tar.bz2 g09.tar.bz2

[dlqc@cluster soft]$ tar -jxf g09.tar.bz2

解壓完成會在當前目錄多出一個“g09”的目錄。

我們可以把這個目錄放入到我們想要的路徑里面做歸檔處理，例如在自己的home目錄創建一個soft目錄“soft”目錄我們可以放入我所有的軟件，這樣后期查找起來也比較方便。

我們的這個軟件放入到了如下目錄

[dlqc@cluster soft]$ pwd

/home/dlqc/soft

現在我們處理環境變量

[dlqc@cluster soft]$ cd ? #我們使用cd命令回到“用戶的根目錄”下面，編輯環境變量文件。

[dlqc@cluster ~]$ vi .bashrc #.bashrc是設置本用戶的環境變量

[dlqc@cluster ~]$ mkdir gstmp #創建一個高斯臨時文件存儲目錄，這里面有個權限問題，如果這個高斯你自己使用，那么不用去管，默認創建就可以了。

如果你的高斯是多人使用，那么需要涉及到權限問題，這個后期在發文章。

打開以后添加如下內容：

注意：“~”linux里面的這個符號，是表示用戶的根目錄，也就是和“/home/dlqc"等值。

注意：“$”linux里面的這個符號，是表示變量值，后面可以接相應的單詞。

#Gaussian env

export g09root=/home/dlqc/soft

export GAUSS_SCRDIR=~/gstmp #所以~/gstmp和/home/dlqc/gstmp等值，寫哪個都可以。

source $g09root/g09/bsd/g09.profile #因為上面已經聲明了一個g09root變量了，所以這句話我們需要引用這個變量然后加上相應的目錄，來查找我們需要執行哪個文件，使其讓高斯的環境變量生效。

“$g09root”等同于/home/dlqc/soft

那么第三句的完整寫法意思是：

source /home/dlqc/soft/g09/bsd/g09.profile

“$g09root”意思就是替代“/home/dlqc/soft”目錄。沒有其他什么功能，就是大家默認的約定規定。

我們安裝高斯，只用上面的三句就可以了，其他都是我做的解釋，你們了解就行了。

設置完成環境變量，必須要讓他生效，使用命令：

source ~/.bashrc

不報錯誤，就可以了。

在終端直接輸入g09看看是否和下面的提示一樣，一樣的話，高斯就全部安裝完成了。

[dlqc@cluster ~]$ g09

Entering Gaussian System, Link 0=g09

下面進行測試高斯是否好用。進入下面的目錄：

/home/dlqc/soft/g09/tests/com

隨便拷貝出來一個.com文件，這個文件可以打開，我們高斯的計算參數可以在這個文件里面設置。

[root@cluster ~]# vi?test300.com

%mem=6gb ?#可以申請多少內存進行作業計算，這里我們是6GB

%nprocshared=2 #可以申請多少核心進行作業計算，這里我們申請了2個核心。

可以把這兩個參數添加到文件的第一第二行

內容如下：

%mem=6gb

%nprocshared=2

#p cas(6,6)/d95 mp2 test iop(5/42=5) guess=cards

Gaussian Test Job 300:

Water localize Strongly occ (42=5)

r = re ?Full CI = -76.1579 ?SCF mp2 = -75.1493 cas mp2 = -76.1529

0 1

O

H ?1 .975

H ?1 .975 2 ?110.5

(4E20.8)

-1

0.5809834509E+00 ? ?0.4612416518E+00 ? -0.6437319952E-04 ? ?0.1724432549E-02

0.1282235396E-14 ? ?0.5417658499E-13 ? ?0.1639966912E-02 ? -0.9146282229E-15

-0.6407549694E-13 ? -0.4538843604E-03 ? ?0.6038992958E-04 ? -0.1131035485E-03

編輯完成以后，我們就可以開始運行測試了。

輸入命令：正常現在就應該開始計算了。

[root@cluster ~]# g09 test300.com

在目錄下面會出現.out的輸出文件，我們可以進行查看作業狀態。

有問題可以聯系我，同時我也承接服務器，linux系統，虛擬化，高性能計算維護。

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總結

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