Gaussian 09的安裝與使用

一、Gaussian 09的安裝

以linux為例子，假設(shè)使用光盤安裝、bash環(huán)境下安裝、命令行提示符為”>”。

假設(shè)安裝目錄為”dir”, 光盤的目錄為/media/cdrom, 計劃使用g09的用戶組為g09

>export g09root=”dir”

>export mntpnt=/media/cdrom

>cd $g09root

>tar -zvxf $mntpnt/tar/*.tgz

>chgrp -R grp g09

>cd g09

>./bsd/install

二、Gaussian 09的使用

假設(shè)g09安裝目錄為“dir”， G09的Scrath files目錄為“sdir”

>export g09root=”dir”

>export GAUSS_SCRDIR=”sdir”

或者將上述兩行命令加入到文件$g09root/g09/bsd/g09.profile

每次運行G09前先運行：

>source?$g09root/g09/bsd/g09.profile

三、運行一個實例

假設(shè)該作業(yè)名稱為test429.com，結(jié)果為test429.log

>$g09root/g09/g09 < test429.com > test429.log

＊Linda版并行的Gaussian09與普通版Gaussian(共享內(nèi)存并行)版的安裝沒有區(qū)別。只是在通過HPC計算時因為作業(yè)管理系統(tǒng)的原因，在使用上要注意：作業(yè)管理系統(tǒng)(比如PBS，LSF，SGE)先獲得計算資源，通過內(nèi)置的變量獲得節(jié)點名稱傳遞給Gaussian就可以了；而單機共享內(nèi)存并行不需要考慮節(jié)點名稱。比如PBS類的作業(yè)管理系統(tǒng)，”$PBS_NODEFILE”給出當前作業(yè)”$PBS_JOBID”的節(jié)點名稱，將節(jié)點名稱賦值給變量GAUSS_WDEF就可以實現(xiàn)跨節(jié)點并行。

參考資料

四、快速入門教程

五、尋求技術(shù)支持

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的高斯09linux教程,Gaussian 09的安装与使用的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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