lammps建模時，我們使用create_atoms創建原子，有些情況下，需要刪除一些原子，用到的命令為：delete_atoms。
delete_atoms語法：

delete_atoms style args keyword value ...

下面介紹delete_atoms常見的用法
1.刪除組內或區域內原子
整組或者整個區域刪除原子，直接使用group或者region關鍵字即可，刪除原子后原子ID已經不連續，使用compress yes可對ID序號進行壓縮，也就是重新排序，產生連續的原子ID。

#刪除edge組內所有原子 delete_atoms group edge #刪除sphere區域內所有原子，并且不壓縮ID delete_atoms region sphere compress no

2. 刪除重疊原子
在不同區域內填充原子，有可能會造成兩區域邊界部分原子重疊，產生重疊的原子之間受力過大容易飛出box，出現“lost atoms”錯誤。
因此，在建模時可刪除重疊原子，用的命令為：
delete_atoms overlap args = cutoff group1-ID group2-ID
group1-ID、group2-ID為兩個原子組，cutoff確定原子間距，間距在cutoff內并且分別處于兩個組內的原子之一（group1-ID組）會被刪除。
如：

delete_atoms overlap 0.3 group1 group2

3. 隨機刪除原子
按照一定比例隨機刪除原子，比如隨機產生空位，語法為：
delete_atoms porosity args = region-ID fraction seed
fraction為刪除原子比例，seed為隨機數種子。

delete_atoms porosity cube 0.1 482793

4. 刪除分子
分子含有多個原子，如果僅刪除一個原子，如H2O僅刪除一個H或者一個O原子，在模擬的時候可能會報錯。
這時候就需要刪除整個H2O分子，加上關鍵字mol即可。

delete_atoms overlap 0.5 Water Cu mol yes

以上為delete_atoms的主要用法，更高級的使用說明請查詢官網手冊。

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的lammps教程：delete_atoms 命令详解的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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