目錄-我和VASP的故事

• 0 寫在前面
• 1 學習記錄
• • 1.1 十一月23日的學習
  • 1.2 十一月24日的學習
  • 1.3 O${}_2$分子體系計算

0 寫在前面

師從大師兄，有興趣可以私信交流，學習教材來源：learn VASP The Hard Way

VASP是什么？即Vienna Ab-initio Simulation Package，是維也納大學Hafner小組開發的進行電子結構計算和量子力學-分子動力學模擬軟件包。它是目前材料模擬和計算物質科學研究中最流行的商用軟件之一。

說明：
Ab-initio——量子化學從頭算起法
本人是windows用戶，后文都以windows系統標準說明。

1 學習記錄

1.1 十一月23日的學習

學習必備參考書：Density Functional Theory: A Practical Introduction (David Sholl)

學習必備網站：VASP官網、VASP官方論壇

---

注意：windows用戶計算出錯時，首要解決方案：dos2unix

需要安裝基礎軟件：
文字編輯軟件：notepad++
建模相關軟件：Material Studio、p4vasp、VESTA

---

四個基本輸入文件：INCAR，KPOINTS，POSCAR，POTCAR
總結：VASP基本輸入文件的準備（小結）

---

批量處理部分初學可以先不看，選擇跳過繼續閱讀下去~

關于VASP任務的提交：
一般來說超算中心使用的都是linux系統，基本操作指令大同小異，基本沒有區別。
這里以本人所在課題組所用的超算中心為例，僅供參考：我們采用的是HPCPlus平臺。
1、 把腳本vasp-5.4.4.lsf 和其他四個輸入文件放在同一個文件夾里；
2、 登錄超算中心，點擊網頁版命令下面的文件傳輸，建立自己的文件夾，把五個文件上傳至超算的文件夾里；
3、 點擊終端命令，打開登錄結點命令，進入剛建立的文件夾，輸入bsub -J Jobname<vasp-5.4.4.lsf（其中Jobname可以換成自己的項目名字）,回車運行。這里我換成 bsub -J Zachary_Job<vasp-5.4.4.lsf
注：
進入-cd；
查看當前目錄-ls
運算過程中可以多用一下命令查看進度：

• cat oszicar查看運行步數，其中關注E0
• bjobs

運行完成后文件夾中會出現一系列輸出文件，目前需要掌握的是這三個輸出文件：
1、CONTCAR是結構優化后，存儲新結構的文件，即優化版的POSCAR；
2、OSZICAR是記錄優化過程一些信息的文件，通過OSZICAR獲取體系的能量，也就是E0后面的那一項；
3、 OUTCAR是關于我們當前計算的一個非常全面的，多方位的信息匯總。
強調：不知道的參數，不要瞎往INCAR里面放！新手的話經常會加一些亂七八糟的參數，導致計算錯誤

1.2 十一月24日的學習

1.3 O${}_2$分子體系計算

總結

以上是生活随笔為你收集整理的VASP学习记录与总结的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

如果覺得生活随笔網站內容還不錯，歡迎將生活随笔推薦給好友。