1. 對于UNIX用戶

(1)下載BioPerl的源代碼，并解壓。我提供兩個網址：

(2)進入該目錄，然后執(zhí)行下列命令：$ perl Build.PL

$ ./Build test

# ./Build install (注意：執(zhí)行./Build install時必須要有系統(tǒng)管理員權限)

BioPerl和許多其他模塊有依賴關系，所以在安裝過程中系統(tǒng)會反復詢問你是否要安裝XX模塊。你最好要在連接Internet的情況下安裝才行。

如果你只想用BioPerl的核心模塊，不想使用額外附加功能，可以選擇不安裝。但我不敢保證以后使用是否會出現問題。

2. 對于windows用戶

(1)使用ActivestatePerl的PPM(Perl包管理器)來安裝。這種方法速度很慢，如果你機器配置不夠好的話只有等著死機。

(2)使用命令行模式安裝。這種方法很穩(wěn)定，強力推薦。注意安裝全過程必須要有穩(wěn)定的Internet連接?????? 你需要執(zhí)行的命令是：

C:> ppm-shell (回車出現下一行)ppm>

ppm> repo add uwinnipeg

ppm> repo add trouchelle

ppm> install BioPerl

判斷系統(tǒng)上是否已經安裝了一個模塊，可以嘗試使用perldoc命令查看模塊的文檔。如果能夠查閱它的文檔，說明已經安裝成功了。

對于BioPerl來說，我們可以查看其中的一個模塊的文檔：perldoc Bio：：Seq

總結

以上是生活随笔為你收集整理的linux非权限安装bioperl,bioperl的安装的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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