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linux非权限安装bioperl,bioperl的安装

發布時間:2023/12/10 linux 32 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 linux非权限安装bioperl,bioperl的安装 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

1. 對于UNIX用戶

(1)下載BioPerl的源代碼,并解壓。我提供兩個網址:

(2)進入該目錄,然后執行下列命令:$ perl Build.PL

$ ./Build test

# ./Build install (注意:執行./Build install時必須要有系統管理員權限)

BioPerl和許多其他模塊有依賴關系,所以在安裝過程中系統會反復詢問你是否要安裝XX模塊。你最好要在連接Internet的情況下安裝才行。

如果你只想用BioPerl的核心模塊,不想使用額外附加功能,可以選擇不安裝。但我不敢保證以后使用是否會出現問題。

2. 對于windows用戶

(1)使用ActivestatePerl的PPM(Perl包管理器)來安裝。這種方法速度很慢,如果你機器配置不夠好的話只有等著死機。

(2)使用命令行模式安裝。這種方法很穩定,強力推薦。注意安裝全過程必須要有穩定的Internet連接?????? 你需要執行的命令是:

C:> ppm-shell (回車出現下一行)ppm>

ppm> repo add uwinnipeg

ppm> repo add trouchelle

ppm> install BioPerl

判斷系統上是否已經安裝了一個模塊,可以嘗試使用perldoc命令查看模塊的文檔。如果能夠查閱它的文檔,說明已經安裝成功了。

對于BioPerl來說,我們可以查看其中的一個模塊的文檔:perldoc Bio::Seq

總結

以上是生活随笔為你收集整理的linux非权限安装bioperl,bioperl的安装的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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