由于博主最近在學習大數據的基礎，避免不了要搭建以hadoop，hbase，hive等軟件為基礎的環(huán)境，這一路的bug可謂是層出不窮啊！在歷經萬苦后終于將前面的都安裝好了，順利了一會兒，沒想到在數據可視化的R語言這又出現(xiàn)了問題!該開始的問題是Ubuton無法更新源頭的問題，反復嘗試始終沒法解決，后面回想起當初安裝MangoDB也是遇上了這樣的情況，雖然無法使用最新版，但沒辦法初學者一時也找不出啥問題只好使用ubuton系統(tǒng)自帶的R語言包了！

使用R語言進行可視化必須要安裝四個依賴庫：RMySQL，ggplot2，devtools，taiyun/recharts。

然而就是這里出現(xiàn)問題：使用install.packages('RMySQL')安裝RMySQL提示

package? ‘panelvar’? is?? not??? available（for?? R???? version?? 3.2.3）

開始我以為是自己的R語言安裝版本過低不支持RMySQL的安裝然后沒辦法就百度各種R語言卸載的方式，看得我實在是眼花繚亂，就百度了報錯的原因，果然不是位R語言版本的問題，也還算可以,不用卸載R語言包了。

命令前有>表示在R交互環(huán)境執(zhí)行，沒有>表示在終端命令模式執(zhí)行。

sudo apt-get install libmariadb-client-lgpl-dev

然后使用：

> install.packages('DBI')

安裝DBI。

下載RMySQL的離線安裝包：地址： https://cran.r-project.org/web/packages/RMySQL/index.html

R CMD INSTALL RMySQL_0.10.14.tar.gz

使用如上命令安裝RMySQL，更改為自己的安裝包名字，同時要在安裝包所在位置下執(zhí)行該命令！

假如依舊報錯，唉嘿嘿嘿，終于不要屈服與系統(tǒng)了，接下來可以使用以下的命令安裝

source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("包名")

?如果安裝DBI的時候安裝不了，也可以使用該命令，親測有效哦！我是用了這個方法安裝了DBI然后再用離線方式安裝了RMySQL

如果還不行？

唉，我該怎么說才好呢？

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?

沒關系，木葉永不言敗！終極奧義：

首先登錄網址：

https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive

或者

https://cran.r-project.org/src/contrib/00Archive

該網址幾乎包括了R語言的所有依賴包，可以找到每個軟件的不同版本

之后如下操作就可以了;

進入R

$ R?

>?packageurl <- "http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ggplot2_1.0.1.tar.gz"?

>?install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source)

進行安裝時可能會跳出錯誤如：

ERRO:dependencies? ?? 'plyr'?? ,?? 'digest'??? are??? not?? available??? for ?? package ? ? 'ggplot2'

removing?? '/media/cx/HDDF/PipeLine/RNA_ref_2016/software/R-3.2.3/libarary/ggplot2'

這是因為缺少‘plyr’和‘digest’兩個依賴庫，所以在進行ggpplot2的安裝時應該用同樣的方法先安裝‘plyr’和‘digest’兩個依賴庫。

安裝其他依賴庫的同時可能還會報錯如：

* installing *source* package ‘RCurl’ ...
** 成功將‘RCurl’程序包解包并MD5和檢查
checking for curl-config... no
Cannot find curl-config
ERROR: configuration failed for package ‘RCurl’
* removing ‘/home/dav/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/RCurl’

?ERROR:?configuration?failed?for?package?‘xml2’

這是因為缺少安裝四個組件：安裝命令：

sudo apt-get install libssl-dev

?sudo apt-get install libssh2-l-dev

?sudo apt-get install libcur14-openssl-dev

?sudo apt-get install libxml2-dev

博主遇上的暫時只有這三個，假如還有其他的，可以自行百度一下安裝方式，應該是大同小異的;

到此R語言的配置就安裝好啦！

最后執(zhí)行

>devtools::install_github('taiyun/recharts')??????? 安裝taiyun/recharts

可以在R的交互環(huán)境下查看安裝的包：命令

>.packages(all.available=TRUE)

?

R是自由軟件，不帶任何擔保。
在某些條件下你可以將其自由散布。
用'license()'或'licence()'來看散布的詳細條件。

R是個合作計劃，有許多人為之做出了貢獻.
用'contributors()'來看合作者的詳細情況
用'citation()'會告訴你如何在出版物中正確地引用R或R程序包。

用'demo()'來看一些示范程序，用'help()'來閱讀在線幫助文件，或
用'help.start()'通過HTML瀏覽器來看幫助文件。
用'q()'退出R.

> .packages(all.available=TRUE)
? [1] "askpass"?????? "assertthat"??? "backports"???? "BH"????????? ?
? [5] "BiocInstaller" "bitops"??????? "boot"????????? "brew"??????? ?
? [9] "callr"???????? "class"???????? "cli"?????????? "clipr"?????? ?
?[13] "clisymbols"??? "cluster"?????? "codetools"???? "colorspace"? ?
?[17] "crayon"??????? "curl"????????? "DBI"?????????? "desc"??????? ?
?[21] "devtools"????? "dichromat"???? "digest"??????? "evaluate"??? ?
?[25] "fansi"???????? "foreign"?????? "fs"??????????? "ggplot2"???? ?
?[29] "git2r"???????? "glue"????????? "gtable"??????? "htmltools"?? ?
?[33] "htmlwidgets"?? "httr"????????? "ini"?????????? "jsonlite"??? ?
?[37] "labeling"????? "lattice"?????? "lazyeval"????? "magrittr"??? ?
?[41] "MASS"????????? "Matrix"??????? "memoise"?????? "mgcv"??????? ?
?[45] "mime"????????? "munsell"?????? "openssl"?????? "pillar"????? ?
?[49] "pkgbuild"????? "pkgconfig"???? "pkgload"?????? "plyr"??????? ?
?[53] "prettyunits"?? "processx"????? "ps"??????????? "R6"????????? ?
?[57] "rcmdcheck"???? "RColorBrewer"? "Rcpp"????????? "RCurl"?????? ?
?[61] "recharts"????? "remotes"?????? "reshape2"????? "rlang"?????? ?
?[65] "RMySQL"??????? "roxygen2"????? "rpart"???????? "rprojroot"?? ?
?[69] "rstudioapi"??? "rversions"???? "scales"??????? "sessioninfo" ?
?[73] "stringi"?????? "stringr"?????? "survival"????? "sys"???????? ?
?[77] "tibble"??????? "utf8"????????? "viridisLite"?? "whisker"???? ?
?[81] "withr"???????? "xml2"????????? "xopen"???????? "yaml"??????? ?
?[85] "base"????????? "compiler"????? "datasets"????? "graphics"??? ?
?[89] "grDevices"???? "grid"????????? "KernSmooth"??? "methods"???? ?
?[93] "nlme"????????? "nnet"????????? "parallel"????? "spatial"???? ?
?[97] "splines"?????? "stats"???????? "stats4"??????? "tcltk"?????? ?
[101] "tools"???????? "utils"?????? ?
>

警告：如果明明安裝成功了，但查詢不到已經安裝的包的時候，看看是不是用的用su-?? 調用了別的用戶安裝，如果是那么必須要從該用戶進入R環(huán)境方可以查詢到。博主就是在普通用戶上調用了root用戶，因為可能要使用達到sudo命令.

大部分包都可以通過這幾個方法安裝成功，有時候用這個辦法不成功，用另外幾個方法又能成功，這就需要大家自己去嘗試了

最后附上幾個貼子的鏈接：

https://jingyan.baidu.com/article/4ae03de3cade393eff9e6bfc.html

http://bi.dataguru.cn/thread-348303-1-1.html

http://blog.sina.com.cn/s/blog_838d33c00102vug9.html

https://blog.csdn.net/Flyfish111222/article/details/79836813?

總結

以上是生活随笔為你收集整理的大数据----------------R语言下依赖库与依赖包的安装的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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