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编程问答

8月26日计算机视觉理论学习笔记——医疗影像分割

發布時間:2023/12/16 编程问答 26 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 8月26日计算机视觉理论学习笔记——医疗影像分割 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

文章目錄

  • 前言
  • 一、影像存儲方式
    • 1、DICOM 醫學數字成像和通信標準
    • 2、MHD/RAW
    • 3、NRRD
  • 二、醫學影像任務
  • 三、改進的 U-NET
    • 1、目標函數-Dice 系數
    • 2、U-NET 未能解決的一些問題
  • 四、3D U-NET
  • 五、V-Net
  • 六、FC-DensNet


前言

本文為8月26日計算機視覺理論學習筆記——醫療影像分割,分為六個章節:

  • 影像存儲方式;
  • 醫學影像任務;
  • 改進的 U-NET;
  • 3D U-NET;
  • V-Net;
  • FC-DensNet。

一、影像存儲方式

1、DICOM 醫學數字成像和通信標準

應用于:

  • 放射醫療;
  • 心血管成像;
  • 放射診療診斷設備。

2、MHD/RAW

MND 文件里包含:

  • RAW 文件——原始影像信息的頭信息,比如:圖片大小、拍攝日常;

3、NRRD

包含元數據和 RAW 信息,并進行了壓縮。

二、醫學影像任務

對 MRI 影像中的前列腺組織進行分割,即判斷出影像中的每一個像素點是否屬于前列腺組織。

三、改進的 U-NET

  • 用于生物影響分割的深度學習模型;
  • 全卷積神經網絡,輸入和輸出都是圖像,沒有全連接層。

1、目標函數-Dice 系數

Dice 距離用于度量兩個集合的相似性,可用于計算兩個字符串的相似度和圖形掩碼區域的差異,取值范圍為 0 到 1:
s=2∣X∩Y∣∣X∣+∣Y∣s = \frac{2|X \cap Y|}{|X| + |Y|} s=X+Y2∣XY?

2、U-NET 未能解決的一些問題

  • 組織器官的頂層截面和底層截面與中部截面差異過大而不易識別;
  • 不同掃描影響之間有較大的外觀變異;
  • 磁場不均勻引起的偽影和畸變。
  • 四、3D U-NET

    以 3D 數據作為輸入,并用相應的操作來處理數據,包括3D 卷積、3D 最大池和3D 向上卷積層。

    • 假設:
      • 輸入數據的維度為:[a1,a2,a3][a1, a2, a3][a1,a2,a3]
      • 通道數:ccc
      • 過濾器大小:fff
      • 過濾器維度:f×f×f×cf\times f\times f\times cf×f×f×c
      • 過濾器數量:nnn
      • 三位卷積的最終輸出為:[a1?f+1,a2?f+1,a2?f+1,a3?f+1,n][a1 - f + 1, a2 - f + 1, a2 - f + 1, a3 - f + 1, n][a1?f+1,a2?f+1,a2?f+1,a3?f+1,n]

    五、V-Net

    U-NET 的另一個 3D 版本。

    • 殘差學習機制:
    • 把縮小端的底層特征送入放大端的相應位置幫助重建高質量圖像,并且加速模型收斂;
    • 每一個 stage 中也使用了躍層連接。

    六、FC-DensNet

    • Dense block 結構:
      • 第一層輸入:x0x_0x0? 有 m個特征圖;
      • 第一層輸出:x1x_1x1? 有 k個特征圖;
      • k個特征圖與 m個特征圖串聯,作為第二層的輸入;
      • 重復 n次;
      • 第 n層的 layer 輸出后與前面的 layer 輸出合并,共有 n×k 個特征圖。


    總結

    以上是生活随笔為你收集整理的8月26日计算机视觉理论学习笔记——医疗影像分割的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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