常見的繪制熱圖的方法有很多，如可用R包，OmicSare tools的熱圖工具，Heml等繪制。那么常規的科研作圖軟件 Origin 能不能繪制熱圖呢？今天就用Origin嘗試下繪制熱圖。

數據準備

本文的示例數據使用周老時在《》一文中所用的數據，是一個包含20個樣本，30個基因的表達量的“數據框”，通過點擊閱讀原文可到OmicSare論壇下載。

將數據復制粘貼到Origin中后，計算樣本兩兩之間的相關系數(當然也可以將數據轉置后計算基因間的相關系數)，具體方法見下面的動圖。

計算結果會在新的Sheet中給出相關系數矩陣，以及對應的p-value值等，如下圖，而本文主要用其中的相關系數矩陣。

熱圖繪制

Origin表格的與Excel的表格相類似，選中相關系數矩陣表中的數據部分，通過Plot\Contour\Heat Map(見下圖)進入數據選擇窗口。

然后，在數據選擇窗口確定X軸和Y軸標簽所對應的數據，主要的參數設置見下圖。

點擊OK按鈕，即可獲得初步的繪制結果，見下圖。

下面開始為每個“格子”添加數據標簽。

由于這一版本無直接添加標簽的功能，這里需要“間接”的方法。思路是為每個“格子”添加與之對應的數據點，然后為數據點添加標簽，最后將這些數據點和連線隱藏。

添加數據之前，需要把多列數據合并為1列，選中數據后，通過Worksheet\Stack columns堆疊數據，注意勾選Include othercolumns，方法見下圖。

將堆疊生成的數據復制到一個新表中(注意，這一步很有必要，否則接下來步驟的可能會添加數據不成功)，選中C(Y)列后右鍵，在Properties窗口將列中數據設為兩位小數，方法如下。

然后右鍵A列，將A列數據設置為X，全選B(Y)列數據，將鼠標指針移到右側邊緣處，拖動到熱圖上，釋放鼠標，完成數據添加，方法如下。

然后雙擊熱圖，進入Plot Details窗口，改變細線(Line)的透明度來隱藏連線，然后給Label 添加C(Y)數據，見下圖。

圖表美化與導出

Origin 繪制的熱圖像繪制其他類型圖表相似，可自由的進行自定義美化，方法也很相似。例如可以更改隱藏“坐標軸”等，更有用的是改變“色條”的數值范圍(右鍵熱圖，在 Colormap 菜單下改變 level)，以及在Plot details窗口中自定義漸變顏色，見下圖。

最的繪制結果如下圖：

Tips：

今天的重點是在學習繪制熱圖的過程中，學會如何用Origin計算相關性系數；如何將多列數據堆疊為1列，以及給繪制好的圖表上添加Data(Label)的技巧。

今天的內容就到這里啦~

總結

以上是生活随笔為你收集整理的origin做相关性分析图_如何用Origin绘制热图？的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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