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编程问答

极速实时荧光定量PCR仪助力科研检测

發布時間:2023/12/29 编程问答 35 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 极速实时荧光定量PCR仪助力科研检测 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

PCR的時候,你是否還在費心的準備冰盒,是否還在擔憂會否因為室溫太高導致酶活降低甚至失效,今天小編為大家mark一家專門且只提供PCR相關試劑的供應商——Solis BioDyne,為你解開這些煩憂。Solis BioDyne運用獨特的蛋白質穩定技術,確保其PCR試劑具有極高的穩定性,即便是在室溫條件下放置1個月,酶活也絲毫不受影響,而且不管你做的是哪種PCR技術,Solis BioDyne都能滿足你的需求。

Solis BioDyne來源于歐盟-愛沙尼亞共和國,自1995年以來,Solis BioDyne一直致力于開發和生產高品質的生命科學試劑,現已成為當今歐洲領先的試劑供應商之一。高標準的生產標準和服務使Solis BioDyne成為全球值得信賴的良選PCR供應商。我們的DNA聚合酶,PCR Master Mixes,qPCR Mixes和其它試劑被全球110多個國家的研究者所使用,包括多個研究機構和生物技術公司(微信搜索“澤平科技”可咨詢此技術)。

1.熱啟動PCR(hot start PCR)

在傳統的PCR反應中,反應體系各成分(Taq DNA聚合酶、dNTP 和引物等)均是一次加入并進入循環,在反應溫度由室溫(25℃)上升至高溫(94~95℃)過程中,可能發生引物錯配和二聚體的形成。引物與模板中一些非靶位點的錯配和引物之間形成的二聚體,在Taq酶的作用下均可延伸,這些非特異性產物又可以在后面的PCR循環中繼續擴增,使非特異性產物不斷積累,同時,也消耗反應體系的各成分,最終PCR擴增的特異性產物大大減少。熱啟動PCR(hot start PCR)是指DNA聚合酶只有在樣品溫度至少超過70℃時才發揮作用的PCR。通過這種方式控制PCR反應的必須組分DNA聚合酶,直到反應混合物被加熱到可以阻止非特異引導和引物聚合的溫度后,再啟動PCR達到有效擴增特異性PCR產物的目的。

*UNG酶通常和熱啟Taq酶一同用于建立含有UNG/dUTP防污染體系的熱啟動PCR反應系統。

UNG酶(Uracil-N-glycosylase,尿嘧啶-N-糖基化酶)的作用原理是選擇性水解斷裂含有dU的雙鏈或單鏈DNA中的尿嘧啶糖苷鍵,形成的有缺失堿基的DNA鏈在堿性介質以及高溫下會進一步水解斷裂,從而被消除。UNG酶的最丨佳活性溫度為50℃,95℃滅活。作用:為保證PCR結果的準確性,要預防非特異性PCR擴增和污染。常用的措施是使用UNG酶(Uracil-N-Glycosylase)和Taq 酶熱啟動。PCR反應常見,最重要的污染物是PCR產物,防污染熱啟動PCR試劑盒以dUTP取代dTTP,所以PCR產物都是含有dU的DNA鏈。在PCR開始前增加50℃的保溫步驟,UNG酶即可將反應體系中已有的U-DNA污染物中的尿嘧啶堿基降解,并在隨后變性這步的條件下DNA鏈斷裂,消除由于污染DNA產生的擴增,從而保證擴增結果的特異性,準確性。

2.高保真PCR

Taq酶具有5'-3'DNA聚合酶活性和5'→3'的外切酶活性,缺少3'→5'的外切酶活性,但沒有從3'→5'方向外切酶的活性,擴增得到的PCR產物的3'末端附有一個“A”堿基,可直接用于TA克隆,但是由于不具有3'→5'外切酶活性,因而在合成中對某些單核苷酸錯配沒有校正功能。DNA聚合酶的校正能力決定了保真度,會影響DNA序列復制的準確性。Solis Biodyne提供的blend mix同時包含Taq酶和校正酶,使得PCR反應既具有5'→3'方向合成DNA的功能,又具有3'→5'方向外切酶的活性和糾錯功能。

3.多重PCR

多重PCR是指在同一PCR反應體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的 PCR反應。多重PCR不僅意味著節省時間、試劑和樣品,還能夠同時對比多個擴增子。

在多重PCR中,因無法僅針對一個引物對或目的片段進行反應優化,而是要考慮到所有引物和靶標,所以可能會出現非特異性擴增和效率降低。因此,為盡量減少由非特異性擴增導致的錯配,應對引物進行精心設計。首先,引物序列應盡可能與其目的序列一一對應,并且所有引物的 Tm相差不應超過5°C。其次,在多重PCR開始前,應利用單個PCR反應驗證每個引物對的特異性和擴增效率。此外,擴增子應具有不同的大小,從而能夠通過凝膠電泳對其進行分離鑒定。

4.長片段PCR

常規PCR反應可以擴增到3~4kb的DNA丨片段,而超過5kb的DNA丨片段就已經很難擴增出來了。長片段PCR即是指擴增大于5kb的DNA丨片段。NCBI推薦的基因克隆供應商GeneCopoeia可提供長片段PCR試劑盒,可擴增18kb人來源gDNA以及30kb λ噬菌體DNA為模板等大片段DNA,同時可擴增高GC%片段,適用范圍廣,實驗過程中僅需添加引物與模板,操作簡便。

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5.高GC含量PCR

在DNA(A、T、C、G)4種堿基中,鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比率稱為GC含量。因為G、C之間形成三對氫鍵,解鏈所需能量較高,所以模板很難打開,高GC含量(G+C≥60%)模板擴增中所面臨的主要困難是模板中容易形成穩定的二級結構妨礙DNA聚合酶在模板上的推進,而且模板上可能存在多個非特異性的引物復性位點,導致非特異性擴增,甚至很多時候擴增不出靶基因。Solis BioDyne可專業提供專業的高GC含量模板的PCR增強劑和預混液,可適用于GC含量高至79%的模板,輕松解決高GC含量PCR的難題。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的极速实时荧光定量PCR仪助力科研检测的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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