极速实时荧光定量PCR仪助力科研检测
PCR的時候,你是否還在費心的準(zhǔn)備冰盒,是否還在擔(dān)憂會否因為室溫太高導(dǎo)致酶活降低甚至失效,今天小編為大家mark一家專門且只提供PCR相關(guān)試劑的供應(yīng)商——Solis BioDyne,為你解開這些煩憂。Solis BioDyne運用獨特的蛋白質(zhì)穩(wěn)定技術(shù),確保其PCR試劑具有極高的穩(wěn)定性,即便是在室溫條件下放置1個月,酶活也絲毫不受影響,而且不管你做的是哪種PCR技術(shù),Solis BioDyne都能滿足你的需求。
Solis BioDyne來源于歐盟-愛沙尼亞共和國,自1995年以來,Solis BioDyne一直致力于開發(fā)和生產(chǎn)高品質(zhì)的生命科學(xué)試劑,現(xiàn)已成為當(dāng)今歐洲領(lǐng)先的試劑供應(yīng)商之一。高標(biāo)準(zhǔn)的生產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)和服務(wù)使Solis BioDyne成為全球值得信賴的良選PCR供應(yīng)商。我們的DNA聚合酶,PCR Master Mixes,qPCR Mixes和其它試劑被全球110多個國家的研究者所使用,包括多個研究機構(gòu)和生物技術(shù)公司(微信搜索“澤平科技”可咨詢此技術(shù))。
1.熱啟動PCR(hot start PCR)
在傳統(tǒng)的PCR反應(yīng)中,反應(yīng)體系各成分(Taq DNA聚合酶、dNTP 和引物等)均是一次加入并進入循環(huán),在反應(yīng)溫度由室溫(25℃)上升至高溫(94~95℃)過程中,可能發(fā)生引物錯配和二聚體的形成。引物與模板中一些非靶位點的錯配和引物之間形成的二聚體,在Taq酶的作用下均可延伸,這些非特異性產(chǎn)物又可以在后面的PCR循環(huán)中繼續(xù)擴增,使非特異性產(chǎn)物不斷積累,同時,也消耗反應(yīng)體系的各成分,最終PCR擴增的特異性產(chǎn)物大大減少。熱啟動PCR(hot start PCR)是指DNA聚合酶只有在樣品溫度至少超過70℃時才發(fā)揮作用的PCR。通過這種方式控制PCR反應(yīng)的必須組分DNA聚合酶,直到反應(yīng)混合物被加熱到可以阻止非特異引導(dǎo)和引物聚合的溫度后,再啟動PCR達到有效擴增特異性PCR產(chǎn)物的目的。
*UNG酶通常和熱啟Taq酶一同用于建立含有UNG/dUTP防污染體系的熱啟動PCR反應(yīng)系統(tǒng)。
UNG酶(Uracil-N-glycosylase,尿嘧啶-N-糖基化酶)的作用原理是選擇性水解斷裂含有dU的雙鏈或單鏈DNA中的尿嘧啶糖苷鍵,形成的有缺失堿基的DNA鏈在堿性介質(zhì)以及高溫下會進一步水解斷裂,從而被消除。UNG酶的最丨佳活性溫度為50℃,95℃滅活。作用:為保證PCR結(jié)果的準(zhǔn)確性,要預(yù)防非特異性PCR擴增和污染。常用的措施是使用UNG酶(Uracil-N-Glycosylase)和Taq 酶熱啟動。PCR反應(yīng)常見,最重要的污染物是PCR產(chǎn)物,防污染熱啟動PCR試劑盒以dUTP取代dTTP,所以PCR產(chǎn)物都是含有dU的DNA鏈。在PCR開始前增加50℃的保溫步驟,UNG酶即可將反應(yīng)體系中已有的U-DNA污染物中的尿嘧啶堿基降解,并在隨后變性這步的條件下DNA鏈斷裂,消除由于污染DNA產(chǎn)生的擴增,從而保證擴增結(jié)果的特異性,準(zhǔn)確性。
2.高保真PCR
Taq酶具有5'-3'DNA聚合酶活性和5'→3'的外切酶活性,缺少3'→5'的外切酶活性,但沒有從3'→5'方向外切酶的活性,擴增得到的PCR產(chǎn)物的3'末端附有一個“A”堿基,可直接用于TA克隆,但是由于不具有3'→5'外切酶活性,因而在合成中對某些單核苷酸錯配沒有校正功能。DNA聚合酶的校正能力決定了保真度,會影響DNA序列復(fù)制的準(zhǔn)確性。Solis Biodyne提供的blend mix同時包含Taq酶和校正酶,使得PCR反應(yīng)既具有5'→3'方向合成DNA的功能,又具有3'→5'方向外切酶的活性和糾錯功能。
3.多重PCR
多重PCR是指在同一PCR反應(yīng)體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的 PCR反應(yīng)。多重PCR不僅意味著節(jié)省時間、試劑和樣品,還能夠同時對比多個擴增子。
在多重PCR中,因無法僅針對一個引物對或目的片段進行反應(yīng)優(yōu)化,而是要考慮到所有引物和靶標(biāo),所以可能會出現(xiàn)非特異性擴增和效率降低。因此,為盡量減少由非特異性擴增導(dǎo)致的錯配,應(yīng)對引物進行精心設(shè)計。首先,引物序列應(yīng)盡可能與其目的序列一一對應(yīng),并且所有引物的 Tm相差不應(yīng)超過5°C。其次,在多重PCR開始前,應(yīng)利用單個PCR反應(yīng)驗證每個引物對的特異性和擴增效率。此外,擴增子應(yīng)具有不同的大小,從而能夠通過凝膠電泳對其進行分離鑒定。
4.長片段PCR
常規(guī)PCR反應(yīng)可以擴增到3~4kb的DNA丨片段,而超過5kb的DNA丨片段就已經(jīng)很難擴增出來了。長片段PCR即是指擴增大于5kb的DNA丨片段。NCBI推薦的基因克隆供應(yīng)商GeneCopoeia可提供長片段PCR試劑盒,可擴增18kb人來源gDNA以及30kb λ噬菌體DNA為模板等大片段DNA,同時可擴增高GC%片段,適用范圍廣,實驗過程中僅需添加引物與模板,操作簡便。
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5.高GC含量PCR
在DNA(A、T、C、G)4種堿基中,鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比率稱為GC含量。因為G、C之間形成三對氫鍵,解鏈所需能量較高,所以模板很難打開,高GC含量(G+C≥60%)模板擴增中所面臨的主要困難是模板中容易形成穩(wěn)定的二級結(jié)構(gòu)妨礙DNA聚合酶在模板上的推進,而且模板上可能存在多個非特異性的引物復(fù)性位點,導(dǎo)致非特異性擴增,甚至很多時候擴增不出靶基因。Solis BioDyne可專業(yè)提供專業(yè)的高GC含量模板的PCR增強劑和預(yù)混液,可適用于GC含量高至79%的模板,輕松解決高GC含量PCR的難題。
總結(jié)
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