目錄

• 基本步驟
• 軟件推薦
• 代碼部分
• 草圖輸出
• 福利

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主要記錄科研中遇到的通用數據處理過程

源代碼下載：Deformation of Amorphous Polyethylene，不過里面的data不是以文件形式提供的，不太方便。

所以可以從我的資源里下載：deformTest.tar.gz，里面含有基本的源數據和對應的處理py腳本。

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基本步驟

得到數據文件（來源于各種仿真程序，通常可以導致指定格式的文件。批量讀取文件的話，需要考慮到文件夾內文件的排序以及文件類型問題）

得到文件中的數據（讀取上述文件中的數據，需要考慮到數據的篩選清洗、以及時間步的平均調整）

對數據進行可視化（哪怕excel都可以做出好看的圖，只是綜合來看可以完成以上步驟的同時還需要可視化，建議使用一門編程語言，例如Python）

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軟件推薦

IDE部分建議使用Spyder，界面和Matlab類似。

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代碼部分

#!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Fri Jan 8 12:37:24 2021@author: yuanbaoqiangThis is a simple py to handle the data in multi txt files, mainly including three steps:1. ENSURE YOUR DATA FILES2. OBTAIN YOUR DATA3. PLOT """# Import modules you need to deal with your files # glob,os ---> file processing import glob,os # pandas ----> data processing import pandas as pd # matplotlib ----> plot import matplotlib.pyplot as plt######################################################## # 1. FIND THE PATH, AND LOAD NEEDED FILES IN THIS PATH# To get the py file's absolute path path=os.getcwd() # Add all .txt files in the path above file=glob.glob(os.path.join("*.txt")) # Sort all .txt files you have added file.sort() # You can also sort all files by using the keyword in your file name with the lamba experession below # file.sort(key = lambda x: int(x[13:-4])) print('You have added ' + str(len(file)) + ' files, and they are ' + str(file))# Define a empty list # List named "df" is to store your data in every file seperately in a dataframe element df = [] # List named "names" is to define column names of every dataframe names = [] names1 = ['strain', 'pxx', 'pyy', 'pzz', 'lx', 'ly', 'lz' , 'temp']; names2 = ['strain', 'epair', 'ebond', 'eangle', 'edihed'] names.append(names1) names.append(names2)######################################################## # 2. OBTAIN THE DATA IN FILES YOU HAVE LOADED# Traverse the list and obtain the needed frame in each file i = 0 for f in file:# Official interpretation about "pandas.read_csv", which is the most "read" command I have used# https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.read_csv.htmldf.append(pd.read_csv(f, delim_whitespace=True, names=names[i], skiprows=[0]))i = i + 1######################################################## # 3. JUST PLOT USING THE DATA YOU NEEDED# Plot a simple graph, and you can see a rough prototype like the "strain-stress" curve in the paper: # 10.1016/j.polymer.2010.10.009 plt.plot(df[0][:]['strain'], df[0][:]['pxx'])

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草圖輸出

不含數據的處理，只是一個基本草圖輸出，但從趨勢來看是和論文大致相同的。

10.1016/j.polymer.2010.10.009論文中的圖：

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福利

本群在lammps學習過程中給予了我莫大的幫助，群里很活躍，歡迎小伙伴的加入~

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的数据处理-拉伸中的strain-stress曲线的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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