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圖形化開放式生信分析云平臺產品開發 - 1 需求分析及技術實現
圖形化開放式生信分析云平臺產品開發 - 2 樣本信息處理
圖形化開放式生信分析云平臺產品開發 - 3 生信分析流程的進化
圖形化開放式生信分析云平臺產品開發 - 4 生信分析流程的圖形化
圖形化開放式生信分析云平臺產品開發 - 5 生信分析流程服務器端運行
圖形化開放式生信分析云平臺產品開發 - 6 生信分析流程批量運行與過程控制

在前文中描述了生信分析流程的整個設計、圖形化、服務器端運行、批量運行與過程控制（手動停止，恢復運行、覆蓋運行），本文嘗試解決分析報告的模板定制與自動生成。

軟件獲取：官網sliverworkspace.com免費下載個人版，最新版本 2.0.277363

需求分析：

報告模板版式設計(視圖)：

• 封面
• 配色
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• 聯系方式
• 頁眉頁腳

分析流程的輸出數據(數據)：

• 通用信息：樣本信息、患者信息、日期信息、檢測項目、報告編號等等。

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• 分析流程輸出的數據：如腫瘤項目中的SNV，CNV，SV等；可以是一個標準數據集，也可以是多個。

  下面是分析流程中SV的輸出結果：根據項目需要定義，實際上還會加上各種關聯的數據庫的數據，也可以實現：

• 分析流程輸出圖表：分析流程輸出的圖表，圖片；最終顯示在報告上面。

報告的自動生成，就是將分析流程的輸出數據用模版填充，并提供下載。

技術選型

這里可以選擇的技術大致有兩種：

將數據渲染顯示為Web端（即網頁）的形式，需要時候打印為PDF下載，這是最常用的方式。優點是下載之前可以預覽報告，便于調整。缺點是，個性化定制能力稍差，調整范圍不大。如果項目很多，則基本上共用一套模板，最多在顏色、字體上做些調整。就像某老板講的從報告上一看就知道你用了哪套程序，同質化嚴重

模板格式直接使用Office Word格式，由word設計模板版式，下載的時候填充數據，下載之后打開預覽。優點是，畢竟word的使用門檻比設計web網頁低得多。設計的靈活性大的多。而且，下載之后還可以人工修改、打印成PDF格式。缺點是，下載之前沒有辦法預覽，沒有web端顯示那么直觀。

經過反復比對，為了提高整個平臺的靈活性，避免過度同質化，這里采用Office Word文件格式來實現報告模板的定制與報告生成。

技術實現

要將設計好的word格式文件，作為模板使用，就需要一套語法，將準備好的數據集用變量顯示，生成報告的時候用實際數據替換變量得到報告。

這里舉一個簡單的例子：

如下圖，年齡字段這里做了簡單的邏輯判斷，如果patient.patientAge==null顯示為""空字符，如果patient.patientAge!=null則直接顯示patient.patientAge對應的數值。

如下圖：

通用數據格式，按照以上形式拼寫：${變量名.屬性名}來表示相應的值，對于分析流程輸出的數據集，也需要設計好語法，與之對應。

[外鏈圖片轉存失敗,源站可能有防盜鏈機制,建議將圖片保存下來直接上傳(img-BgUCcxAK-1571713440405)(https://i.loli.net/2019/10/18/or6n4D1guW5adip.png)]

對應的數據如下圖，實際上還會加上各種關聯的數據庫的數據，如有需要也可以實現。：

CNV分析輸出的圖片插入模板：

對應字段${image[‘cnv_scatter.png’]}輸出報告后如下圖：

您可以下載PPT或加QQ群:853718264討論

總結

以上是生活随笔為你收集整理的图形化开放式生信分析系统开发 - 7 分析报告的模板定制与自动生成的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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