100+医学影像数据集集锦
醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)集集錦
前言
本項(xiàng)目的目標(biāo)是整理一個(gè)醫(yī)學(xué)影像方向數(shù)據(jù)集的列表，提供每個(gè)數(shù)據(jù)集的基本信息，并對(duì)其中License允許的提供不限速下載。項(xiàng)目按照數(shù)據(jù)集關(guān)注的器官對(duì)其進(jìn)行分類(lèi)。需要整理的數(shù)據(jù)集很多，我們十分期待大佬們?yōu)轫?xiàng)目作出貢獻(xiàn)。
- 如果您發(fā)現(xiàn)項(xiàng)目已有的內(nèi)容中有任何錯(cuò)誤（包括但不限于md格式問(wèn)題，網(wǎng)址失效，數(shù)據(jù)錯(cuò)誤，簡(jiǎn)介信息補(bǔ)充等），可以通過(guò)Pull/Request進(jìn)行修正。
- 如果您想用的數(shù)據(jù)集沒(méi)有出現(xiàn)在列表中，請(qǐng)按照模板提交Issue，并盡量詳細(xì)地描述數(shù)據(jù)集信息。我們會(huì)盡快添加，若License允許可以免費(fèi)代下。
當(dāng)前共收錄約 20 個(gè)方向的 100+ 個(gè)數(shù)據(jù)集
PS:平時(shí)不看CSDN消息，任何問(wèn)題煩請(qǐng)?zhí)醾€(gè)Issue或在我的博客文章下方評(píng)論。
轉(zhuǎn)載請(qǐng)聯(lián)系項(xiàng)目維護(hù)者:me@linhan.email
目錄
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- 肝臟
- LiTS
- Sliver07
- 3D-IRCADB
- CHAOS
- TCGA-LIHC
- MSD肝臟血管分割
- 肺
- MSD肺癌分割
- LoLa11肺葉分割
- StructSeg2019
- 肺部多病智能診斷
- CheXpert
- NIHChest Xray
- QIN Lung CT
- 4D-Lung
- NSCLC-Radiomics
- vessel12 肺部血管分割
- 肺結(jié)核
- Shenzhen Hospital X-ray Set
- Montgomery County X-ray Set
- 肺炎
- Ieee8023
- covid19-ct-scans
- COVID-CT
- Figure1-COVID-chestxray-dataset
- RSNA肺炎檢測(cè)
- CovidX
- Flyai Covid
- covid19-radiography-database
- COVID-19-AR
- CT Images in COVID-19
- 肺結(jié)節(jié)
- LIDC-IDRI
- LUNA16
- 天池肺部結(jié)節(jié)
- LNDB
- Lung Nodule Malignancy
- Data Science Bowl 17
- Lung-PET-CT-Dx
- 氣胸
- SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation
- 胸
- CBIS-DDSM
- QIN Breast
- Rider Breast MRI
- ACRIN 6688
- BraTS2015
- 腦
- MSD腦瘤分割
- MSD海馬體分割
- Iseg2019
- ABIDE
- ADNI
- CQ500
- 腦出血
- RSNA Intracranial Hemorrhage Detection
- 腎臟
- Kits19
- 腸
- CT COLONOGRAPHY
- MSD腸道分割數(shù)據(jù)集
- 心臟
- EchoNet
- MMWHS
- MSD心臟分割
- 主動(dòng)脈
- 冠狀動(dòng)脈分割
- 眼睛
- DRIVE
- ODIR-5k
- FIRE 視網(wǎng)膜圖像數(shù)據(jù)
- STARE
- CHASE_DB1
- IDRiD
- 細(xì)胞
- Data Science Bowl 18
- 血細(xì)胞涂片分類(lèi)
- ISBI細(xì)胞跟蹤
- 骨骼
- MURA-1.1
- RSNA Bone Age
- 磁共振圖像脊柱結(jié)構(gòu)多類(lèi)別三維自動(dòng)分割
- 膝蓋
- MRNet
- 脊椎
- Verse大規(guī)模脊椎分割數(shù)據(jù)集
- 前列腺
- PANDA
- MSD前列腺分割
- QIN-PROSTATE-Repeatability
- 胰腺
- MSD胰腺分割
- PDMR-833975-119-R
- 皮膚
- SIIM-ISIC Melanoma Classification
- VQA
- PathVQA
- 內(nèi)窺鏡
- SARAS-MESAD
- SARAS-MESAD
- 醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)庫(kù)
- 參考項(xiàng)目/列表
- 貢獻(xiàn)者
- Release Note
肝臟
LiTS
| LiTS | 肝臟/肝臟腫瘤 | 分割 | CT | 131+70 | 0/1標(biāo)簽 | nii | CC 4.0 |
LiTS數(shù)據(jù)集包含131套訓(xùn)練掃描和70組測(cè)試數(shù)據(jù)，其中70組測(cè)試數(shù)據(jù)標(biāo)簽不公開(kāi)。LiTS訓(xùn)練集中包含3DIRCADB中的所有數(shù)據(jù)，所以如果合并多個(gè)數(shù)據(jù)集不要合并這兩個(gè)。Medical Segmentation Decathlon中肝臟分割的數(shù)據(jù)集就是LiTS。
分割結(jié)果可以在線提交進(jìn)行評(píng)估，在線提交方法參考。 在線提交地址
數(shù)據(jù)集論文：The Liver Tumor Segmentation Benchmark (LiTS)
相關(guān)項(xiàng)目： 基于Paddle的肝臟CT影像分割
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Sliver07
| Sliver07 | 肝臟 | 分割 | CT | 20+10 | 0/1標(biāo)簽 | MetaImage | Other |
這個(gè)數(shù)據(jù)集比較老了，現(xiàn)在用的也比較少，一些研究會(huì)將sliver和lits合起來(lái)，這樣基本上就是所有常用的關(guān)于肝臟分割的公開(kāi)數(shù)據(jù)了。mhd格式可以用 SimpleITK 讀，在medseg項(xiàng)目中有轉(zhuǎn)換成nii的腳本
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3D-IRCADB
| 3D-IRCADb 01 02 | 肝臟/肝腫瘤 | 分割 | CT | 20+2 | surface mesh | dcm | CC |
3D-IRCADb是比較早的一個(gè)數(shù)據(jù)集，有兩個(gè)子集，分別包含20組和2組CT片子。
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CHAOS
| CHAOS | 肝/腎/脾 | 分割 | CT+MRI | 40CT+120MRI | 0/1標(biāo)簽 | dcm | CC 4.0 |
CHAOS是一個(gè)多臟器，多模態(tài)分割數(shù)據(jù)集。
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-ML21YiIl-1636195013833)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/chaos.png)]
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TCGA-LIHC
| TCGA-LIHC | 肝 | CT/MR/PT | 97患者/237套 | 無(wú)標(biāo)簽 | dcm | Other |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-Sr35CLBK-1636195013837)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/tcga-lihc.jpg)]
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MSD肝臟血管分割
| MSD肝臟血管分割 | 肝臟血管 | 分割 | CT | 443 | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-nNojbcKa-1636195013847)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/Hepatic-Vessels.png)]
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肺
MSD肺癌分割
| MSD肺癌分割 | 肺臟 | 分割 | CT | 96 | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-yn7hWlPm-1636195013850)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/Lung-Tumours.png)]
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LoLa11肺葉分割
| LoLa11 | None | 分割 | CT | 55 | None | Metaimage | Other |
LoLa11 包含55套CT數(shù)據(jù)，未發(fā)現(xiàn)任何公開(kāi)標(biāo)注信息
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StructSeg2019
| StructSeg2019 |
肺部多病智能診斷
| 肺部多病智能診斷 | CT |
CheXpert
| CheXpert | Other |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-duTwLsh1-1636195013855)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/chest-x-pert.png)]
介紹論文： CheXpert: A Large Chest Radiograph Dataset with Uncertainty Labels and Expert Comparison
相關(guān)項(xiàng)目
NIHChest Xray
| NIHChest Xray | 14種肺部疾病/部分病灶位置 | 分類(lèi)/檢測(cè) | CXR | 112,120 | csv | png | CC0: Public Domain |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-yZ51mSFM-1636195013856)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/nih-chest-xray.png)]
介紹論文： ChestX-ray8: Hospital-scale Chest X-ray Database and Benchmarks on Weakly-Supervised Classification and Localization of Common Thorax Diseases
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QIN Lung CT
| QIN Lung CT | 非小細(xì)胞癌 | CT | 47 | dcm | Other |
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4D-Lung
| 4D-Lung | 非小細(xì)胞癌 | CT | 20 | dcm | Other |
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NSCLC-Radiomics
| NSCLC-Radiomics | 非小細(xì)胞癌 | 分割 | CT | 422 | dcm |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-GcJ6ahL0-1636195013857)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/NSCLC-Radiomics.png)]
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vessel12 肺部血管分割
| vessel12 肺部血管分割 | 肺部血管 | 分割 | CT | 20 | raw |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-AB33diWL-1636195013858)(https://grand-challenge-public-prod.s3.amazonaws.com/b/1/header.x15.jpeg)]
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肺結(jié)核
Shenzhen Hospital X-ray Set
| Shenzhen Hospital X-ray Set | 肺結(jié)核/正常 | 分類(lèi) | CXR | 662 | 類(lèi)別 | 圖片 |
深圳第三醫(yī)院收集的肺結(jié)核胸透數(shù)據(jù)集，包含326張正常掃描和336張不正常的掃描。
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Montgomery County X-ray Set
| Montgomery County X-ray Set | 肺結(jié)核/正常 | 分類(lèi) | CXR | 138 | 類(lèi)別 | 圖片 |
蒙哥馬利市收集的肺結(jié)核胸透數(shù)據(jù)集，包含80張正常的掃描和58張不正常的掃描。
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肺炎
Ieee8023
| Ieee8023 | 肺臟 | 分類(lèi) | CT | 20 | nii |
持續(xù)搜集公開(kāi)的新冠CT掃描，目前有20個(gè)病例。
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covid19-ct-scans
| covid19-ct-scans | 左右肺/新冠感染 | 分割 | CT | 20 | nii |
數(shù)據(jù)來(lái)自Ieee8023，對(duì)20組掃描進(jìn)行了左右肺和感染區(qū)的標(biāo)注?；谶@個(gè)數(shù)據(jù)集和另外幾個(gè)數(shù)據(jù)集，大佬們做了一個(gè)新冠分割的 benchmark
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COVID-CT
| COVID-CT | 分類(lèi) | CT | 349 | 圖片 |
包含216名新冠患者的349張胸部CT圖片，從相關(guān)paper中收集。
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Figure1-COVID-chestxray-dataset
| Figure1-COVID-chestxray-dataset | 分類(lèi) | CXR | 48 | 圖片 |
DarwinAI收集的一些新冠CT的圖片，是CovidX數(shù)據(jù)集的一部分。持續(xù)更新，使用前可以先pull。
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RSNA肺炎檢測(cè)
| RSNA肺炎檢測(cè) | 之否肺炎/肺炎區(qū)域BB | 分類(lèi)/檢測(cè) | CXR | 26684+3000 | 圖片 |
RSNA是北美放射學(xué)會(huì)在Kaggle上組織的一個(gè)比賽數(shù)據(jù)集，數(shù)據(jù)來(lái)自NIH。包含26684張訓(xùn)練數(shù)據(jù)，有圖片的分類(lèi)和肺炎區(qū)域的邊界框。
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CovidX
| CovidX | 新冠/其他肺炎/正常 | 分類(lèi) | CT | 13569+231 | 圖片 |
CovidX數(shù)據(jù)集是DarwinAI訓(xùn)練CovidNet做的一個(gè)數(shù)據(jù)集，本身沒(méi)有新的數(shù)據(jù)，是Ieee8023，Figure1和RSNA組合成的一個(gè)數(shù)據(jù)集。
Flyai Covid
| Flyai Covid |
Flyai舉辦的一個(gè)新冠分類(lèi)比賽。
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covid19-radiography-database
| covid19-radiography-database | 新冠/其他肺炎/正常 | 分類(lèi) | CT | 219+1314+1345 | 圖片 |
跟CovidX一樣是一個(gè)組合數(shù)據(jù)集，數(shù)據(jù)來(lái)自論文圖片和RSNA。
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COVID-19-AR
| COVID-19-AR | dcm |
Chest Imaging with Clinical and Genomic Correlates Representing a Rural COVID-19 Positive Population (COVID-19-AR)
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CT Images in COVID-19
| CT Images in COVID-19 | 無(wú)標(biāo)簽 | 分類(lèi)/分割 | CT | 650 | 無(wú) | nii |
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肺結(jié)節(jié)
LIDC-IDRI
| LIDC-IDRI | 肺部腫瘤 | 目標(biāo)檢測(cè) | CT | 1012 | xls | dcm |
介紹論文： The Lung Image Database Consortium (LIDC) and Image Database Resource Initiative (IDRI): A Completed Reference Database of Lung Nodules on CT Scans
The public cancer radiology imaging collections of The Cancer Imaging Archive
Aistudio下載 Part1 Part2
LUNA16
| LUNA16 |
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天池肺部結(jié)節(jié)
| 天池肺部結(jié)節(jié) | 肺部結(jié)節(jié) | 檢測(cè) | 低劑量肺部CT | 1000(初賽) + 2000(復(fù)賽) | 位置+直徑 | mhd | Custom |
LNDB
| LNDB | 直徑大于3mm的腫瘤分割標(biāo)注/小于3mm腫瘤和非腫瘤標(biāo)記中心 | 分割/分類(lèi) | CT | 294 | XML | MetaImage |
介紹論文： LNDb: A Lung Nodule Database on Computed Tomography
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Lung Nodule Malignancy
| Lung Nodule Malignancy | 肺結(jié)界良惡性 | 分類(lèi) | CT | 4165+2526 | tif |
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Data Science Bowl 17
| Data Science Bowl 17 |
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Lung-PET-CT-Dx
| Lung-PET-CT-Dx | 肺癌 | 目標(biāo)檢測(cè) | CT | 363 | xml | dcm |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-tRU10Ywx-1636195013860)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/Lung-PET-CT-Dx.png)]
氣胸
SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation
| SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation |
胸
CBIS-DDSM
| CBIS-DDSM | 正常/良性/惡性 | 分類(lèi) | CT | 2620 |
介紹論文： Deep Learning to Improve Breast Cancer Early Detection on Screening Mammography A curated mammography data set for use in computer-aided detection and diagnosis research
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QIN Breast
| QIN Breast 0102 | MRI | 67 |
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Rider Breast MRI
| Rider Breast MRI | MRI |
ACRIN 6688
| ACRIN 6688 | CT | 83 |
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BraTS2013
| BraTS2013 |
BraTS2015
| BraTS2015 |
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BraTS2021
| BraTS2015 |
腦
MSD腦瘤分割
| MSD Brain Tumor Segmentation | 膠質(zhì)瘤/腫瘤/水腫 | 分割 | MRI | 484 Train + 266 Test | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
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MSD海馬體分割
| MSD Hippocampus Segmentation | 海馬體 | 分割 | MRI | 394 | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-d4tph43w-1636195013862)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/msd-hippocampus.png)]
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Iseg2019
| Iseg2019 |
ABIDE
| ABIDE | 是否有自閉癥 | 分類(lèi) | MRI | 539+573 |
自閉癥患者的頭部MRI掃描，包含539例自閉癥患者和573個(gè)正常掃描對(duì)照組。 介紹論文： The autism brain imaging data exchange: towards a large-scale evaluation of the intrinsic brain architecture in autism.
下載地址
ADNI
| ADNI |
介紹論文： Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI)
CQ500
| CQ500 | 分割 | CT | 491組掃描 | by-nc-sa 4.0 |
介紹論文:Development and Validation of Deep Learning Algorithms for Detection of Critical Findings in Head CT Scans
腦出血
RSNA Intracranial Hemorrhage Detection
| RSNA Intracranial Hemorrhage Detection | CT |
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腎臟
Kits19
| Kits19 | 腎臟/腎腫瘤 | 分割 |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-AE35434R-1636195013863)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/kits19.png)]
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腸
CT COLONOGRAPHY
| CT COLONOGRAPHY | CT |
包含沒(méi)有結(jié)腸息肉，有6-9mm息肉和大于10mm息肉的數(shù)據(jù)。
MSD腸道分割數(shù)據(jù)集
| MSD腸道分割數(shù)據(jù)集 | 結(jié)腸癌原發(fā)病灶 | 分割 | CT | 126訓(xùn)練+64測(cè)試 | CC-BY-SA 4.0 |
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心臟
EchoNet
| EchoNet | 心臟 | 分割 | MRI | 10300 | 0/1 |
介紹論文： EchoNet-Dynamic: a Large New Cardiac Motion Video Data Resource for Medical Machine Learning
MMWHS
| MMWHS | 心臟 | 分割 | CT / MRI | 20CT、20MRI | 類(lèi)別 | nii |
mmwhs是心臟分割數(shù)據(jù)集，共有8類(lèi)，MRI和CT兩種模態(tài) 相關(guān)項(xiàng)目： Hybrid Loss Guided Convolutional Networks for Whole Heart Parsing
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MSD心臟分割
| MSD心臟分割 | 左心房 | 分割 | MRI | 20(訓(xùn)練)+10(測(cè)試) | CC-BY-SA 4.0 |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-dV0EDM1c-1636195013864)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/mds-cardiac.png)]
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主動(dòng)脈
冠狀動(dòng)脈分割
| Automated Segmentation of Coronary Arteries | 冠狀動(dòng)脈 | 分割 | CTA | 40+20 | Custom |
Grand Challenge下載
眼睛
DRIVE
| DRIVE | 眼底血管 | 分割 | 眼底照片 | 40 | 0/1 | 圖片 |
DRIVE數(shù)據(jù)集是一個(gè)糖尿病病人眼底血管分割數(shù)據(jù)集。
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ODIR-5k
| ODIR-5k | 正常和7種疾病 | 分類(lèi) | 眼底彩色照片 | 5000 | 圖片 |
ODIR-5K包括5000名患者的年齡，雙眼的彩色眼底照片和醫(yī)生的診斷關(guān)鍵詞。該數(shù)據(jù)集是上工醫(yī)療技術(shù)有限公司從中國(guó)不同醫(yī)院/醫(yī)療中心收集的“真實(shí)”患者信息。在這些機(jī)構(gòu)中，眼底圖像由市場(chǎng)上的各種相機(jī)捕獲，例如Canon，Zeiss和Kowa，因此導(dǎo)致各種各樣的圖像分辨率。病人的識(shí)別信息會(huì)被移除。注釋由經(jīng)過(guò)培訓(xùn)的人類(lèi)讀者進(jìn)行標(biāo)記，并具有質(zhì)量控制管理?；颊叻譃?個(gè)標(biāo)簽，包括正常（N），糖尿病（D），青光眼（G），白內(nèi)障（C），AMD（A），高血壓（H），近視（M）和其他疾病/異常（O）。
FIRE 視網(wǎng)膜圖像數(shù)據(jù)
| FIRE 視網(wǎng)膜圖像數(shù)據(jù) | 分類(lèi) | 視網(wǎng)膜圖像 | 129 |
FIRE 是一個(gè)視網(wǎng)膜眼底圖像數(shù)據(jù)集，包含 129張 眼底視網(wǎng)膜圖像，由不同特征組合成 134對(duì) 圖像組合。這些圖像組合根據(jù)特質(zhì)被劃分為3類(lèi)。眼底圖像由 Nidek AFC-210 眼底照相機(jī)采集，分辨率為2912x2912，視覺(jué)仰角為40度。圖像由 Papageorgiou Hospital 醫(yī)院和Aristotle University of Thessaloniki大學(xué)共同構(gòu)建，由于Thessaloniki 大學(xué)采集自39名患者。. 數(shù)據(jù)包括以下幾部分內(nèi)容： 1.成對(duì)的視網(wǎng)膜圖像。 2.彩色ROI掩模（作為二值圖像）。 3.特征ROI掩模（作為二值圖像）。 4.每個(gè)圖像對(duì)應(yīng)的標(biāo)注點(diǎn)。
STARE
| STARE | 眼底血管 | 分割 | 眼底照片 | 400 | 照片 | 照片 | 無(wú) |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-3emF09zR-1636195013865)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/stare.png)]
STructured Analysis of the Retina數(shù)據(jù)集包含400張眼底照片，作者團(tuán)隊(duì)對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行了多種診斷，并對(duì)部分?jǐn)?shù)據(jù)的血管進(jìn)行了標(biāo)注
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CHASE_DB1
| CHASE_DB1 | 眼底血管 | 分割 | 眼底照片 | 28 | png | png | 無(wú) |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-rnj8gUF3-1636195013868)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/CHASE_DB1.png)]
Kinston大學(xué)公開(kāi)的一個(gè)小規(guī)模眼底分割數(shù)據(jù)集，包含28張眼底照片及對(duì)應(yīng)的分割標(biāo)簽。
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IDRiD
| IDRiD | 常見(jiàn)DR病灶、視盤(pán)、DR病變等級(jí)等 | 分類(lèi)、檢測(cè)、分割 | 眼底照片 | * | tif/csv | jpg | CC BY 4.0 |
Indian Diabetic Retinopathy Image Dataset (IDRiD)
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前列腺
PANDA
| PANDA | 前列腺癌分級(jí) | 鏡檢圖片 | 10616張鏡檢 | 分類(lèi) | tiff |
MSD前列腺分割
| MSD前列腺分割 | 前列腺中央腺體及外周區(qū)域 | 分割 | 多模態(tài)核磁 | 32(訓(xùn)練)+16(測(cè)試) | CC-BY-SA 4.0 |
[外鏈圖片轉(zhuǎn)存失敗,源站可能有防盜鏈機(jī)制,建議將圖片保存下來(lái)直接上傳(img-Ms3lKxSd-1636195013869)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/msd-prostate.png)]
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QIN-PROSTATE-Repeatability
| QIN-PROSTATE-Repeatability | 前列腺癌 | MRI | 15 | dcm |
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胰腺
MSD胰腺分割
| MSD胰腺分割 | 胰腺腫瘤 | 分割 | CT | 282(訓(xùn)練)+139(驗(yàn)證) | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
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PDMR-833975-119-R
| PDMR-833975-119-R | 胰腺癌 | MRI | 20 | dcm |
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皮膚
SIIM-ISIC Melanoma Classification
| SIIM-ISIC Melanoma Classification | 皮膚癌病變類(lèi)別 | 分類(lèi) | 皮膚鏡 | 88.3K張圖片 | 類(lèi)別 | dicom |
目前最大的皮膚鏡圖像集合，用來(lái)在皮膚病變圖像中之別黑色素瘤，圖片以DICOM格式提供，同時(shí)包含圖像元數(shù)據(jù)，有的圖像也以JPEG和TFRecord格式提供，TFRecords格式的圖像已被調(diào)整為統(tǒng)一的1024x1024
細(xì)胞
Data Science Bowl 18
| Data Science Bowl 18 | 細(xì)胞核 | 分割 | 841張/37333個(gè)細(xì)胞核 | 0/1 | 圖片 |
細(xì)胞核分割數(shù)據(jù)集
介紹論文： Nucleus segmentation across imaging experiments: the 2018 Data Science Bowl
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血細(xì)胞涂片分類(lèi)
| 血細(xì)胞涂片分類(lèi) | 四種血細(xì)胞類(lèi)型 | 分類(lèi) | 鏡檢 | 12500 | - | 圖片 |
血細(xì)胞分類(lèi)數(shù)據(jù)集包含12500張四種血細(xì)胞的照片。圖片是從大的血細(xì)胞涂片照片上截下來(lái)的，數(shù)據(jù)集經(jīng)過(guò)增廣。圖片都很小，訓(xùn)練時(shí)注意IO瓶頸。
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ISBI細(xì)胞跟蹤
| ISBI細(xì)胞跟蹤 | 細(xì)胞像素級(jí)別位置 | 跟蹤 | 鏡檢 | 圖片 |
在鏡檢視頻中像素級(jí)跟蹤細(xì)胞位置
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骨骼
MURA-1.1
| MURA-1.1 | 正常/非正常 | 分類(lèi) | x-ray | 40561 |
介紹論文： MURA: Large Dataset for Abnormality Detection in Musculoskeletal Radiographs
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RSNA Bone Age
| RSNA Bone Age |
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磁共振圖像脊柱結(jié)構(gòu)多類(lèi)別三維自動(dòng)分割
| 磁共振圖像脊柱結(jié)構(gòu)多類(lèi)別三維自動(dòng)分割 | 椎骨和椎間盤(pán) | 分割 | MRI T2WI | 172 | 0/1 | nii | Custom |
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膝蓋
MRNet
| MRNet |
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脊椎
Verse大規(guī)模脊椎分割數(shù)據(jù)集
| VerSe | 脊椎 | 分割 | CC BY-SA 4.0 |
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VQA
PathVQA
| PathVQA | 圖片 | 4998圖片/32799問(wèn)答 | 圖片 |
介紹論文： PathVQA: 30000+ Questions for Medical Visual Question Answering
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內(nèi)窺鏡
SARAS-MESAD
| SARAS-MESAD | 24種動(dòng)作 | 靜態(tài)背景動(dòng)作識(shí)別 | 內(nèi)窺鏡 | 4(真實(shí)手術(shù))+5(模擬手術(shù)) | CC BY-NC-SA 4.0 |
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SARAS-MESAD
| SARAS-ESAD | 21種手術(shù)動(dòng)作 | 靜態(tài)背景動(dòng)作識(shí)別 | 內(nèi)窺鏡 | 22,601(訓(xùn)練)+4,574(測(cè)試) | 圖片 | BB | CC BY-NC-SA |
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數(shù)字病理
CAMELYON
| CAMELYON16，17 | 鏡檢 | 圖片 | BB | CC0 |
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醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)庫(kù)
TCIA:The Cancer Imaging Archive
MedPix 包含超過(guò)12000名患者和59000張影像
Belarus tuberculosis portal 包含結(jié)核病人的CT，胸透和檢驗(yàn)數(shù)據(jù)
Grand Challenges
LONI 神經(jīng)相關(guān)醫(yī)學(xué)影像
參考項(xiàng)目/列表
醫(yī)學(xué)影像分割挑戰(zhàn)
胸部\肺部ct數(shù)據(jù)集
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Stanford ML Group
omic tools
各領(lǐng)域公開(kāi)數(shù)據(jù)集
medical-imaging-datasets
Open-Access Medical Image Repositories
Medical Image Datasets Download Links
HAM10000 dataset
Dermatology Image Classification
havard
usc
burkely
isdis
radiopedia
aimi
貢獻(xiàn)者
（按照首次貢獻(xiàn)時(shí)間排序）
多語(yǔ)言代碼生成器 Mail : linhandev@qq.com
自尊心3
底迪
ChenchenHu007
lixinhui541
吖吖查
parap1uie-s
Jianpeng Zhao
Release Note
2021/5/21
開(kāi)始添加數(shù)據(jù)集圖片，接受多次外部貢獻(xiàn)，對(duì)存量數(shù)據(jù)集進(jìn)行合規(guī)檢查，數(shù)據(jù)集總量達(dá)到71
2020/11/20
添加Issue模板，鼓勵(lì)外部貢獻(xiàn)，數(shù)據(jù)集數(shù)量達(dá)到67
2020/11/8
在Github發(fā)布，整理格式，添加多個(gè)數(shù)據(jù)集
2020/6/11
添加LIDC-IDIR，編寫(xiě)數(shù)據(jù)壓縮腳本
2020/6/4
添加MMWHS心臟分割數(shù)據(jù)集，SIIM皮膚病分類(lèi)比賽數(shù)據(jù)集
2020/5/27
添加ISBI細(xì)胞分割，TCGA-LIHC肝臟，4D-Lung肺部數(shù)據(jù)集，圍繞乳腺癌添加一系列數(shù)據(jù)集
2020/5/20
項(xiàng)目添加數(shù)據(jù)集計(jì)數(shù)和release note，數(shù)據(jù)集方面添加 RSNA骨齡，PathVQA，FIRE視網(wǎng)膜，DDSM乳腺癌等數(shù)據(jù)集
2020/5/13
項(xiàng)目在Aistudio公開(kāi)，包含約40個(gè)數(shù)據(jù)集
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的100+医学影像数据集集锦的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。
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