RNA結(jié)合蛋白（RBP）在各種生物學(xué)過(guò)程中都起著至關(guān)重要的作用，它們?cè)赗NA上的結(jié)合位點(diǎn)可以深入了解涉及RBPs的疾病背后的機(jī)制。因此，如何識(shí)別RNA上的RBP結(jié)合位點(diǎn)對(duì)于后續(xù)分析至關(guān)重要。今天，小編就給大家介紹一種基于深度學(xué)習(xí)的RNA-蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)的網(wǎng)站：RBPsuite，這是一個(gè)易于使用的網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器，用于預(yù)測(cè)線性和環(huán)形RNA上的RBP結(jié)合位點(diǎn)。

RBPsuite首先將輸入的RNA序列分割為101個(gè)核苷酸的片段，并對(duì)片段與RBP之間的相互作用進(jìn)行評(píng)分。RBPsuite進(jìn)一步檢測(cè)結(jié)合片段上已驗(yàn)證的基序，從而給出沿全長(zhǎng)序列的結(jié)合得分分布。對(duì)于線性RNA，RBPsuite使用iDeepS來(lái)預(yù)測(cè)它們與RBP的結(jié)合分?jǐn)?shù)；對(duì)于環(huán)狀RNA（circRNA），RBPsuite使用CRIP預(yù)測(cè)它們與RBP的結(jié)合分?jǐn)?shù)。

話不多說(shuō)，主頁(yè)面如下。

RBPsuite需要三種類型的輸入：RNA類型，預(yù)測(cè)模型和RNA序列。電子郵件地址是可選的。如果提供了電子郵件，則作業(yè)完成后將向該電子郵件發(fā)送通知。

Step 1.?選擇?RNA類型

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的RBPsuite RNA-蛋白质结合位点预测工具使用指南的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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