RNA測序（RNA-seq）在過往十年里逐漸成為全轉錄組水平分析差異基因表達和研究mRNA差異剪接必不可少的工具。RNA-seq幫助大家對RNA生物學的理解會越來越全面：從轉錄本在何時何地轉錄到RNA折疊以及分子互作發揮功能等。

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1.RNA-seq相關名詞

詳細介紹了RNA seq的專業詞、高通量測序常用詞、轉錄組測序問題等，是入門RNA seq較好的資料。

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2.什么是RNA-seq？一文讀懂

了解了RNA-seq相關基礎知識，需要進一步了解RNA seq究竟是什么？能做什么？一文讀懂。RNA-seq是一種集合實驗方法和計算機手段的一種技術，它可以確定生物樣本中RNA序列的特征性和豐度。RNA-seq方法的產生源自于測序技術的世代革新。RNA-seq數據可以讓我們知道很多未知的東西，比如，我們可以識別出胚胎干細胞中編碼新蛋白質的轉錄本，可以找到皮膚癌細胞中那些過表達的轉錄本。

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3.RNA-seq測序基本知識

一般來說，NGS測序特別是RNA-seq正在迅速改變實驗的設計和執行方式。由于技術的飛速發展，可以公平地說，對于一個特定問題沒有單一的正確答案。而且許多RNA-seq項目有多個目標，例如，可能需要鑒定樣本中的新基因融合轉錄物，對已知基因的豐度進行量化，并鑒定已知基因中的任何SNP。

因此，根據研究設計原則提供指導是更為合理的，用戶既可以對預期成果充滿信心地計劃項目，也可以理解為什么做出某些選擇。在一項研究中所使用的覆蓋范圍和平臺的數量可能需要進行權衡，而且由于實驗室資源有限，因此需要進行權衡。

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4.RNA-Seq怎么做，又會遇到哪些問題

這兩年隨著測序成本的下降和轉錄組研究的日漸火熱，RNA-seq儼然已經成為了分子生物學課題組推進項目的首選方向。

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5.37個RNA-seq工具大PK，教你數據處理方法如何選擇

RNA-seq技術的廣泛應用為轉錄組研究迎來了一個新時代。根據研究內容的方向，精度、速度和成本要求不同，科研人員需要對包括采取何種具體測序方法流程、樣品類型、所需的分析結果，以及基因組研究現狀和計算數據處理可用資源等內容進行權衡。因為涉及的問題復雜多樣，如何找到一種最佳的工作流程，在成本和性能要求基礎上，通過對RNA-seq分析中涉及到的各個不同環節進行最優選擇，便成為是至關重要的問題。

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6.RNA-seq分析方法

樣本水平分析：轉錄組相似性

基因水平分析：基因表達動力學

轉錄水平分析：轉錄本重構和定量

外顯子水平分析：選擇性剪接中的外顯子包含率

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7.RNA-seq高級分析有哪些？

基因共表達網絡分析（Weighted Gene Co-Expression Network Analysis, WGCNA）

基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis, GSEA）

時序分析

基因融合分析

RNA編輯分析

蛋白互作網絡分析（Protein interaction network analysis, PINA）

代謝途徑可視化分析

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的一文掌握RNA seq，RNA seq课程大汇总的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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