在線平臺(tái)BIC 是 ImageGP的重構(gòu)升級(jí)版，重構(gòu)于2020年初。該平臺(tái)采用配置文件快速部署工具、生成結(jié)果或結(jié)果報(bào)告。其繪圖和分析基于 R 語言(ImageGP 包, 在早期ImageGP腳本的基礎(chǔ)上重新進(jìn)行了封裝， GitHub, Gitee)、Python 語言。

左側(cè)導(dǎo)航目前包括：1. Professional plots in seconds; 2. Data transform and extraction; 3. Bioinformatics analysis; 4. Phylogenetic tree view; 5. Resource.

1.1?功能部分

1.1.1?Professional plots in seconds

目前支持 16 種基本圖形，包括熱圖、箱線圖、富集分析泡泡圖、柱狀圖、火山圖、PcOA 分析、Venn 圖、直方圖、線圖等。每種圖根據(jù)復(fù)雜度不同，有數(shù)目不一的可調(diào)節(jié)參數(shù)，可組合出很多復(fù)合圖形。

1.1.2?Data transform and extraction

常見數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換，如寬矩陣轉(zhuǎn)長矩陣、長矩陣轉(zhuǎn)寬矩陣、合并矩陣、矩陣膨脹等功能。

1.1.3?Bioinformatics analysis

生物信息分析部分包括常見的分析工具如 WGCNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析、LEfSe 特征物種鑒定、Limma 差異基因/物種分析、多序列比對(duì)、FASTA 處理、RNA 翻譯、正則匹配和空間關(guān)系等工具，更多工具也在不斷完善中。

1.1.4?Phylogenetic tree view

這是最近嘗試的基于 D3.js 的交互式圖系列，目前只有進(jìn)化樹展示和多序列比對(duì)展示，后面會(huì)陸續(xù)更新更多交互式圖。

1.1.5 Text and video tutorial

這里包括網(wǎng)站使用幫助、常用教程、經(jīng)典書籍、網(wǎng)址導(dǎo)航等內(nèi)容，正在陸續(xù)更新中。

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機(jī)器學(xué)習(xí)

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的高颜值在线绘图平台ImageGP系列教程 - 功能介绍的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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