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生信的作用越來越大,想學(xué)的人越來越多,不管是為了以后發(fā)展,還是為了解決眼下的問題。但生信學(xué)習(xí)不是一朝一夕就可以完成的事情,也許你可以很短時(shí)間學(xué)會(huì)一個(gè)交互式軟件的操作,卻不能看完程序教學(xué)視頻后就直接寫程序。也許你可以跟著一個(gè)測序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么參數(shù)需要修改,結(jié)果可以出來,卻把握不住對還是錯(cuò)。?
學(xué)習(xí)生信從來就不是一個(gè)簡單的事,需要做好持久戰(zhàn)的心理準(zhǔn)備。?
在學(xué)習(xí)時(shí),我們都希望由淺入深的逐步深入,不斷地練習(xí)和實(shí)踐,這就是為什么我們需要一本書,因?yàn)闀芟到y(tǒng)。但生信發(fā)展的歷史短于計(jì)算機(jī)編程的歷史,如果想要一門程序設(shè)計(jì)的入門數(shù)據(jù),每種語言都可以找到幾本。但想要一個(gè)囊括生信的書,就有些難了。本身生信跨領(lǐng)域,需要多學(xué)科的知識(shí),而其內(nèi)部又有不少分子,都囊括了太大,包括的少又有些隔靴搔癢的感覺。?
我們當(dāng)時(shí)都是零基礎(chǔ)下自學(xué)Linux, ? 自學(xué)Python,自學(xué)R,自學(xué)高通量測序;這些學(xué)習(xí)經(jīng)歷,之前都零星地記錄在博客里。現(xiàn)在回頭去看幾年前自己記錄的東西,覺得好簡單,而當(dāng)時(shí)卻費(fèi)了很大的力氣。這些零星的隨手記,當(dāng)時(shí)也只是為了自己看,到現(xiàn)在確實(shí)只有自己能看得懂,不便惠及更多的人。?
因此我們創(chuàng)建了生信寶典,希望從不同的角度傳播知識(shí)。這個(gè)不同有三點(diǎn)含義,一是形式上的不同,摒棄之前主編們單人作戰(zhàn)想寫啥就寫啥,而是有組織有計(jì)劃的內(nèi)容聚合,提供一系列的教程,由入門到提高。二是內(nèi)容的不同,不去用網(wǎng)上現(xiàn)有教程的通用數(shù)據(jù)做例子,而是拿實(shí)際生物數(shù)據(jù),講述如何解釋生信中普遍碰到的問題,講述如何處理自己的數(shù)據(jù)。三是立足點(diǎn)不同。
在寫作時(shí),我們回到了當(dāng)年,在回憶中用整個(gè)階段的學(xué)習(xí)去指導(dǎo)當(dāng)初的那個(gè)小白,從那些會(huì)了的人覺得微不足道而不會(huì)的人又邁不過的坎入手,直擊痛點(diǎn)。知識(shí)點(diǎn)的收錄依據(jù)不是是否炫酷,是否難,而是是否必要。如果必要,再簡單,也要提及;如果不必要,再炫酷,也暫不納入。?
通過大量的生信例子、關(guān)鍵的注釋和濃縮的語句形成下面的一系列學(xué)習(xí)教程。每一篇內(nèi)容都不多,可以當(dāng)做小說閱讀,也可以跟著去練,反復(fù)幾遍,每讀一次都會(huì)有不同的收獲和體會(huì)。
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總結(jié)
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