寫作排版必備

NGS系列文章包括NGS基礎、轉錄組分析?（Nature重磅綜述|關于RNA-seq你想知道的全在這）、ChIP-seq分析?（ChIP-seq基本分析流程）、單細胞測序分析?(重磅綜述：三萬字長文讀懂單細胞RNA測序分析的最佳實踐教程 （原理、代碼和評述）)、DNA甲基化分析、重測序分析、GEO數據挖掘（典型醫學設計實驗GEO數據分析 (step-by-step) - Limma差異分析、火山圖、功能富集）等內容。

Markdeep: 文檔書寫展示兩不誤

Markdown是一種輕量級標記語言，允許人們使用易讀易寫的純文本格式編寫文檔（別人的電子書，你的電子書，都在bookdown）。手頭只要有一個文本編輯器，不管是在筆記本還是在服務器都可以自由寫作（Linux - VIM的強大文本處理方法）。而且由于是純文本文件，可以方便使用Git管理（Windows輕松實現linux shell環境：gitforwindows）。

寫作是方便了（英語寫作常見錯誤總結和學習視頻），但呈現給別人看時不免就有些麻煩，需要一些支持Markdown的編輯器或轉換工具進行轉換，重要的是不方便回轉。發給別人的Markdown腳步看著不舒服，轉換后看著舒服，修改又不方便了。

現在，有了一個工具Markdeep(一段JavaScript代碼，起始寫于2015年，一直維護升級至今)，使得我們只要在寫作的Markdown文檔中引用下這段代碼（就是簡單的在文件末尾加一句話）就可以輕松實現Markdown和網頁的互轉。

其支持的特性也比較多，常見的Markdown標題等級、代碼高亮、引用、列表、表格等，還支持一些新的功能，簡單列舉幾個：

直接嵌入多種形式的流程圖，如ASCII流程圖 （中文支持不好）和gravizo流程圖，支持。

支持自動生成目錄（層級少時不生成目錄，層級多時生成目錄）。

支持嵌入Base64格式的圖形，解決Markdown圖形引用的問題。

支持引用其它Markdown文件，方便大文件拆分成多個寫作。

（3）和（4）結合起來可以很好的處理圖形引用問題，每個圖形的Base64單獨放一個文件，在主文檔引用展示。

支持嵌入Latex公式（萬能轉換：R圖和統計表轉成發表級的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量圖等）。

支持嵌入視頻。

Markdown格式和HTML格式輕松轉換。

也可以很方便的導出成PDF。

更多功能按需獲取，具體使用請看公眾號里的視頻。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的只需一行代码，完美呈现Markdown格式，写作展示两不误的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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