熱圖是很常見的圖形展示方式，在?圖形解讀系列 | 給你5個示例，你能看懂常用熱圖使用嗎？有詳細描述。熱圖基本原則是用顏色代表數字，讓數據呈現更直觀、對比更明顯。常用來表示不同樣品組代表性基因的表達差異、不同樣品組代表性化合物的含量差異、不同樣品之間的兩兩相似性。實際上，任何一個表格數據都可以轉換為熱圖展示。

熱圖通過將數據矩陣中的各個值按一定規律映射為顏色展示，利用顏色變化來可視化比較數據。當應用于數值矩陣時，熱圖中每個單元格的顏色展示的是行變量和列變量交叉處的數據值的大小；若行為基因，列為樣品，則是對應基因在對應樣品的表達值；若行和列都為樣品，展示的可能是對應的兩個樣品之間的相關性。

注意：正因為熱圖應用如此之廣，又可以表示很多種不同類型數據。解讀熱圖時不要先入為主，直接就給其定性為表達熱圖、相關性熱圖；而是要想看圖例、橫軸、縱軸，結合圖形標題一起解讀。

基因表達熱圖繪制

使用的繪圖數據是DESeq2標準化后的表達矩陣 ehbio.simplier.DESeq2.normalized.rlog.xls。

截取前15行粘貼進入熱圖 (http://www.ehbio.com/Cloud_Platform/front/#/analysis?page=b%27Ng%3D%3D%27)繪制的文本域：

每一行是一個基因，每一列是一個樣品。

點擊Check data確認數據無誤，點擊Submit就可以出圖了。

普普通通一張熱圖，橫坐標重疊一起了，需要調整下，Layout面板下的X-axis ticks rotation angle設置為45度；

再次出圖

最左邊的樣本名字沒有顯示完整，調整下圖形的寬和高

提交后獲得結果

后面再演示聚類等更多操作

測試數據獲取：https://gitee.com/ct5869/bic

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的轻轻松松画个热图的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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