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你的DNA都会玩摇滚了,你却还是个音痴

發布時間:2025/3/15 35 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 你的DNA都会玩摇滚了,你却还是个音痴 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

在KTV對朋友調侃道:“五音不全的你還非得做麥霸,哪兒來的自信!?”,誰知他卻更加來勁兒地說:“骨子里來的!”。一直很佩服他這種“不要臉”的娛樂精神,后來發現他這種來自骨子里的自信不無道理,因為這自信來自基因。

我們知道DNA序列是由四個簡單的字母AGCT(U)組成,1953年沃森和克里克發現了DNA的結構,隨后基因測序技術實現了基因序列的可視化 (測序發展史:150年的風雨歷程)。后來科學家在分析中想要突出顯示某些關鍵元素,于是又開發了眾多序列分析工具,利用顏色、字體或覆蓋其他類型的信息來進一步實現可視化 (基因組瀏覽器是一個重要的可視化工具)。現在又為我們創造了另一種可能:音頻!

2017年4月澳大利亞悉尼大學分子生物學家(兼職鼓手)Mark Templet在BMC Bioinformatics上發表了一篇關于“DNA聽覺顯示器”的工具DNA_SONIFICATION,能實現DNA序列的輸入和音頻輸出。

該工具可以通過網站http://dnasonification.org/ 在線獲得,給定一條DNA序列,它會將序列中的A、C、G、T轉換為虛擬鋼琴、吉他和風琴演奏的音符。在上傳序列之后,用戶可以精確地選擇如何完成“音樂轉錄”。作者提出了六種算法,這些算法在邏輯上從簡單到復雜。其中三種算法是將單個核苷酸,核苷酸對或密碼子解析成音符,分別產生4、16或64個音符。密碼子也可以相對于遺傳密碼簡并解析成20個音符,正如遺傳密碼將64個密碼子映射到20個氨基酸一樣。最后,核苷酸對可以被解析為兩個獨立的幀,或者密碼子可以被解析為三個讀取幀,從而產生多個音頻流。

AlgorithmDNA motif sizeStep range (notes)Number of audio frames (instruments)Silence on STOP codon Restart on START codonSonify occurrence of STOP/START
Reading frame codons3 bp203optionaloptional
Protein sequence3 bp201nooptional
Tri-nucleotides3 bp641nooptional
Di-nucleotide pairs2 bp162nono
Di-nucleotides2 bp161nono
Mono-nucleotides1 bp41nono

試想一下,當你在使用基因組瀏覽器來查看關鍵序列的時候,配上其對應的伴奏音樂,并且用戶還能選擇自己喜歡的音樂風格,這也許有助于我們對DNA序列的視覺理解。Temple確實聯系了UCSC基因組瀏覽器開發團隊,但因為這個音樂的分析意義不明確而被婉拒。

Temple提到,對于重復元素我們可能很難通過眼睛辨別其中細微的變化。在此作者列舉了人類端粒的序列(真核生物染色體末端的一段高度重復序列),最開始 “聲化”的序列聽起來平淡且重復,但是直到它到達單堿基插入位點,此時音樂突然轉變,好像音樂家受到了啟發。

另外Temple通過一次播放所有三個閱讀框架,并且聲音突出啟動和終止密碼子,從而增加了一層分析價值。

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除了Temple還有其他研究人員也編寫過將DNA序列轉換為音頻的算法,并且現在有很多音樂創作者已應用這種算法將序列轉換成了極富創造性的音樂作品。

極致交響曲

將DNA聲化用于音樂創作并做到極致的莫屬于芬蘭。芬蘭是一個內部反差強烈、追求極致的國度,四季與自然是如此,在這種環境下生活的芬蘭人更是如此。2017年芬蘭獨立100周年之際,芬蘭旅游局組織了多名遺傳學家、科技人士、音樂人、創意人,用芬蘭人的DNA譜寫了一支震撼的交響曲(The Symphony of Extremes),以此彰顯芬蘭的文化精髓。

項目第一階段是提取DNA,志愿者來自芬蘭北部極端環境下生活的普通人:在拉普蘭荒野地區與十幾只狗一同生活的女孩 Tinja Myllykangas,杰出的女性極限潛水員 Johanna Nordblad,在芬蘭偏遠群島生活的一群孩子。前期工作由來自赫爾辛基大學遺傳學教授P?ivi Onkamo,芬蘭分子醫學研究所(FIMM)Jaana Saarela完成。P?ivi Onkamo專注于芬蘭歷史傳統中的DNA,Jaana Saarela則負責DNA樣本的收集和分析工作。

下一階段則是聚焦音樂作品和創作,需要將提取的DNA轉譯成音符,這項工作由坦佩雷大學的訪問教授Jonathan Middleton完成,他開發了一套將DNA堿基對轉譯為聲音的程序;最后由重金屬樂隊Apocalyptica成員Eicca Toppinen主要負責將轉譯后的DNA音符二次創作成最終的音樂作品。

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一個是理性的科學王國,一個是風情萬種的藝術世界,兩者在山下分了路,又在山頂會合。期待科學與藝術能碰撞出更多火花!

Reference:

http://blogs.nature.com/naturejobs/2017/07/17/the-sound-of-dna/
https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-017-1632-x
http://dnasonification.org/
http://www.blabbermouth.net/news/apocalyptica-creates-music-from-finnish-dna-the-symphony-of-extremes-video-premiere/
https://www.visitfinland.com/symphonyofextremes/

總結

以上是生活随笔為你收集整理的你的DNA都会玩摇滚了,你却还是个音痴的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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