地大重磅!世界首例古代大熊猫全基因组成功测定
云南騰沖江東山全新世大熊貓骨骼遺存
中國地質大學生物地質與環境地質國家重點實驗室賴旭龍教授領導的研究組,與德國波茲坦大學、云南省文物考古研究所等研究人員合作,成功測定了首例古代大熊貓全基因組。相關研究成果近日在國際知名學術刊物《當代生物學》上在線發表。
樣品采用地,云南騰沖江東山遠景
地大古 DNA 研究團隊成員賴旭龍教授(右)、盛桂蓮副教授(左)等在野外考察
野生大熊貓的棲息地從古至今急劇退縮,在北起我國周口店、南至華南大部乃至越南、緬甸的東南亞廣闊區域留下諸多化石記錄。首例大熊貓古基因組研究樣品系在我國云南騰沖江東山發現的全新世大熊貓個體,放射性碳同位素測年結果顯示該個體生存年代為距今5,025 ± 35 年,是迄今發現的該地區最晚的大熊貓化石記錄。
云南騰沖全新世大熊貓與現生大熊貓的系統演化關系圖
研究人員運用古 DNA 實驗方法和新一代測序技術,得到了 1.2 倍覆蓋度的大熊貓全基因組。對該基因組的分析發現,該全新世大熊貓樣品代表一個與現生大熊貓不同、現已絕滅的大熊貓遺傳譜系;該譜系與現生大熊貓共同祖先種群的分化,早于現生大熊貓三個不同地理種群(即:秦嶺種群、岷山種群、邛崍-大相嶺-小相嶺-涼山種群)的形成,且與現生大熊貓的祖先種群存在基因交流,使得該絕滅譜系的部分基因在現生大熊貓基因庫中幸存。
地大古 DNA 研究團隊與德國波茲坦大學古 DNA 團隊部分成員合影
研究團隊成員與合作者交流
論文的第一及共同通訊作者盛桂蓮副教授表示:對于物種保護而言,除了種群大小這一參數,物種的遺傳多樣性是影響其演化存亡的另一個關鍵因素。本研究確定大熊貓在演化過程中喪失了特定的遺傳譜系,付出過遺傳多樣性降低的代價;絕滅遺傳譜系中通過種群雜交滲透到現生大熊貓基因庫中的少量基因,可能有助于大熊貓在將來的演化過程中更好地適應不斷變化的環境。
賴旭龍教授與德方合作者合影
本項研究得到中國國家自然科學基金、CSC-DAAD 中德科技合作項目、歐洲研究理事會聯合基金資助。2005 年的野外探險考察,得到了美國自然科學基金和云南省科委基礎研究基金的聯合資助,由云南省文物考古研究所與加州科學院聯合組織實施。
總結
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