3篇论文报告了人类微生物组整合计划的研究成果
本周《自然》和《自然-醫學》在線發表了人類微生物組整合計劃(iHMP)的三篇論文,概述了宿主和微生物組之間的互作如何影響人體健康。iHMP 調查了在炎癥性腸病(IBD)、前驅糖尿病、懷孕和早產中,微生物組和宿主的變化。所得發現有助于表征這些疾病,預測病人轉歸,將來或許還能促進治療。
人體微生物組因個體、群體和環境而異,并且已知會影響人類的健康和疾病狀態。iHMP 采用多組學方法探索了微生物組和宿主的時間動態變化(如免疫響應和新陳代謝),以便理解這些疾病中的微生物-宿主互作。
美國哈佛大學陳曾熙公共衛生學院的 Curtis Huttenhower 及同事研究了 132 名 IBD 患者和健康的對照組被試。
在第一篇《自然》論文Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases中,作者鑒定出了微生物組組成的變化、腸道內宿主源和微生物組源分子的變化以及基因表達的轉變。
作者總結表示,這項研究對 IBD 中的宿主和微生物活動進行了迄今為止最全面的描述,有望為理解疾病發病和進展帶來深刻見解。
在 IBDMDB 研究中 IBD 微生物的多組學分析
來源:Priceet al.
在第二篇《自然》論文Longitudinal multi-omics of host–microbe dynamics in prediabetes中,美國斯坦福大學醫學院的 Michael Snyder 小組報告了前驅糖尿病中宿主和微生物組之間的互作。前驅糖尿病會導致糖尿病,但是經常得不到確診。
研究小組對 106 名健康個體和前驅糖尿病個體進行了為期 4 年的研究,分析了分子變化、遺傳變化和微生物變化。他們發現了可以定義早期疾病發展的規律——在某些情況下,這可能有助于及早檢測出 2 型糖尿病。
研究設計摘要及群組細節和數據
來源:Zhouet al.
發表在《自然-醫學》上的論文The vaginal microbiome and preterm birth則描述了陰道微生物對于早產風險(全球早產率超過 10%)的影響。美國弗吉尼亞聯邦大學的 Gregory Buck 及同事在1,527 名孕婦的整個孕期內對其進行了研究,揭示了與早產(不足 37 周)風險相關的陰道微生物組變化,尤其是對非洲裔婦女而言。
例如,研究發現早產孕婦的卷曲乳桿菌(Lactobacillus crispatus)水平低于足月妊娠的孕婦,而過去的研究已經表明卷曲乳桿菌與婦女健康有關。他們還在早產孕婦體內發現了大量過度存在的不同種類細菌。這項研究或許有助于未來提前預測早產。
MOMS-PI 研究數據
來源:Fettweiset al.
總結
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