有以下可能性：1. 比對所用的參考基因組和所測物種不是同一個物種，同源性不夠好，倒閉比對的mapping比率不高； 2. 測到的序列不全是miRNA，有其他RNA序列污染，比如斷裂mRNA，因此與miRBase數據庫比對比率滴；3. 測序樣本有污染，所測樣本與所分析物種不是同一個；4. 所用miRBase數據庫版本太低，沒有收錄入全部已知miRNA，據我所知，miRBase數據庫近兩年更新比較多，而且更新增加的miRNA數據量也不少，如果用了舊版本，是可能發現比對率太低的。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的请教miRNA测序数据比对到参考基因组上是60%左右，但是比对到miRBase数据库上只有7% 这是怎么回事呢？的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

如果覺得生活随笔網站內容還不錯，歡迎將生活随笔推薦給好友。