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单细胞基因组测序在疾病治疗方面有什么应用?

發(fā)布時(shí)間:2023/11/22 万象百科 52 博士
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 单细胞基因组测序在疾病治疗方面有什么应用? 小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
單細(xì)胞基因組測(cè)序是基于單個(gè)細(xì)胞水平上采取高質(zhì)量的全基因組擴(kuò)增與測(cè)序相結(jié)合的一項(xiàng)新技術(shù),用于揭示細(xì)胞群體差異和細(xì)胞進(jìn)化關(guān)系。該技術(shù)目前主要應(yīng)用于腫瘤發(fā)生機(jī)制及胚胎發(fā)育研究。由于腫瘤細(xì)胞之間具有異質(zhì)性,采用該項(xiàng)技術(shù)不需培養(yǎng)細(xì)胞,可最真實(shí)的獲得單克隆癌細(xì)胞的具體突變來源及精準(zhǔn)的突變頻率,以及區(qū)分癌癥發(fā)生、發(fā)展、演化過程中的主動(dòng)與被動(dòng)突變等。單細(xì)胞測(cè)序方法即single cell sequencing(SNS),能準(zhǔn)確定量一個(gè)單細(xì)胞核中基因拷貝數(shù)目。由于癌細(xì)胞中基因組部分被刪除,或者擴(kuò)增,從而引起關(guān)鍵基因的缺失,或者表達(dá)過量,干擾正常細(xì)胞生長(zhǎng),因此利用這種方法就能分析基因拷貝數(shù)目,從而診斷癌癥。生物通 www.ebiotrade.com 近年來這一研究領(lǐng)域成為了癌癥研究的熱點(diǎn)之一,2012年3月23日出版的Cell雜志就以“Single-Cell Sequencing of Cancer”為題,介紹了兩項(xiàng)首次單個(gè)癌細(xì)胞全外顯子測(cè)序的研究成果,這兩項(xiàng)成果分別是針對(duì)血液癌癥,和固體腎臟腫瘤展開的研究。據(jù)介紹,在第一篇“Single-Cell Exome Sequencing and Monoclonal Evolution of a JAK2-Negative Myeloproliferative Neoplasm”文章中,中國(guó)深圳華大基因研究院的研究人員,聯(lián)合西南大學(xué),武漢大學(xué)等處的研究人員對(duì)取自一例典型的原發(fā)性血小板增多癥患者的90個(gè)單細(xì)胞進(jìn)行了全外顯子測(cè)序,通過諸多分析,研究人員揭示了此ET在腫瘤發(fā)生中遵循單克隆演化模型,并鑒定了一些與ET的發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的突變基因。

單細(xì)胞基因組測(cè)序?qū)膊≈委煼浅V匾芙档蚉CR擴(kuò)增偏差,使單細(xì)胞中絕大多數(shù)基因組能夠被測(cè)序。這種方法使得檢測(cè)單細(xì)胞中較小的DNA序列變異變得更容易,因此能夠發(fā)現(xiàn)個(gè)別細(xì)胞之間的遺傳差異。這些差異可以幫助解釋癌癥惡化的機(jī)制,生殖細(xì)胞形成等的機(jī)制,甚至是個(gè)別神經(jīng)元的差異機(jī)制。

單細(xì)胞基因測(cè)序不但可以用來測(cè)量人體的細(xì)胞,還可以對(duì)一些病原體進(jìn)行測(cè)序,發(fā)現(xiàn)其致病原因,制定出相應(yīng)的治療措施。尤其是對(duì)瘧原蟲感染的瘧疾,從病人體內(nèi)分離出的樣本往往是多種寄生蟲和病原體的混合物,使用別的測(cè)序方法,結(jié)果混亂難以分別。而分離出瘧原蟲單體后進(jìn)行測(cè)序,則可以準(zhǔn)確分析出其致病序列。

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)使得檢測(cè)單細(xì)胞中較小的DNA序列變異變得更容易,因此能夠發(fā)現(xiàn)個(gè)別細(xì)胞之間的遺傳差異。癌細(xì)胞中這樣的差異可以幫助解釋癌癥發(fā)生、轉(zhuǎn)移及惡化的機(jī)制;這些差異還可以用于解釋生殖細(xì)胞形成,甚至是個(gè)別神經(jīng)元的差異機(jī)制。總之,需要明確細(xì)胞個(gè)體間差異的時(shí)候,這種技術(shù)變得非常有用。

總結(jié)

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